89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4289 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  29.46 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  32.8 
 
 		 1048 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  35.16 
 
 		 1348 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  34.23 
 
 		 1656 aa  63.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  31.88 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  28.68 
 
 		 441 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  29.55 
 
 		 1016 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  29.55 
 
 		 1016 aa  57.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  36.96 
 
 		 1611 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1808  TIR protein  30.66 
 
 		 500 aa  57  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211372 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  36 
 
 		 552 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  30.53 
 
 		 367 aa  55.5  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  32.79 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0912  hypothetical protein  30.61 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251322  hitchhiker  0.0061785 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  30.68 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  32.67 
 
 		 384 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  30.77 
 
 		 291 aa  52  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2293  hypothetical protein  35.37 
 
 		 358 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120131  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2180  hypothetical protein  35.37 
 
 		 358 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0766  hypothetical protein  37.84 
 
 		 290 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  34.07 
 
 		 404 aa  51.2  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.21 
 
 		 1363 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0031  TIR protein  29.63 
 
 		 544 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.36 
 
 		 880 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 552 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.36 
 
 		 880 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  30.69 
 
 		 517 aa  50.4  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  31.91 
 
 		 859 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  32.69 
 
 		 598 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3566  hypothetical protein  31.82 
 
 		 272 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5724  TIR protein  34.72 
 
 		 942 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00541848 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  26.5 
 
 		 947 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5111  hypothetical protein  27.47 
 
 		 251 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.370649 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  27.68 
 
 		 825 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  32.18 
 
 		 570 aa  47  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  27.2 
 
 		 1373 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  31.08 
 
 		 490 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  31.17 
 
 		 431 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  32.94 
 
 		 386 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 303 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  30.77 
 
 		 586 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  38.36 
 
 		 540 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30 
 
 		 845 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 1526 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3578  hypothetical protein  29.87 
 
 		 387 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4229  hypothetical protein  29.87 
 
 		 387 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  30.77 
 
 		 413 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.86 
 
 		 398 aa  45.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  32.39 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 1279 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  30.68 
 
 		 398 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 1279 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  32.63 
 
 		 992 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0273  TIR protein  26.35 
 
 		 342 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2916  hypothetical protein  32.47 
 
 		 272 aa  44.3  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3047  hypothetical protein  31.18 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  28.57 
 
 		 374 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  24.64 
 
 		 969 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 		 994 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  29.55 
 
 		 566 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0092  response regulator receiver protein  26.36 
 
 		 383 aa  42.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.170556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2657  hypothetical protein  27.45 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.812499  normal  0.815839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4617  GUN4 domain protein  26.13 
 
 		 393 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0355945 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4746  hypothetical protein  32.93 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269368  normal  0.268137 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  31 
 
 		 963 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2653  TIR protein  32 
 
 		 354 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  34.44 
 
 		 541 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  28.21 
 
 		 292 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  28.42 
 
 		 266 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2918  hypothetical protein  30.38 
 
 		 171 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 911 aa  41.6  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1477  TIR protein  28.12 
 
 		 183 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.475025  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1089  TIR protein  23.71 
 
 		 585 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0814211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  32.41 
 
 		 513 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  26.53 
 
 		 320 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 785 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1371  hypothetical protein  28.72 
 
 		 265 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.168893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0481  hypothetical protein  26.88 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1068 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1033  hypothetical protein  31.73 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  31 
 
 		 320 aa  40.8  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  26.36 
 
 		 306 aa  40.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  34.48 
 
 		 431 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0534  hypothetical protein  29.35 
 
 		 356 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.656053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3348  hypothetical protein  23.86 
 
 		 323 aa  40  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.757656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  28.42 
 
 		 316 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3409  hypothetical protein  26.88 
 
 		 796 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.835686  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3771  hypothetical protein  29.49 
 
 		 385 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>