14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_1033 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_1033  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  337  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1266  hypothetical protein  83.87 
 
 		 155 aa  270  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2628  hypothetical protein  81.94 
 
 		 155 aa  268  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0354952 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3770  hypothetical protein  79.35 
 
 		 155 aa  260  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1065  hypothetical protein  66.01 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4746  hypothetical protein  54.49 
 
 		 156 aa  169  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269368  normal  0.268137 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5591  Domain of unknown function DUF1863  43.75 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0362  Domain of unknown function DUF1863  32.62 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0544465  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1252  hypothetical protein  31.58 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.278967  normal  0.262068 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3297  hypothetical protein  32.95 
 
 		 291 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3995  hypothetical protein  30.33 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0444  hypothetical protein  32.03 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  31.73 
 
 		 137 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0190  hypothetical protein  29.63 
 
 		 125 aa  40.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>