15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2918 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2918  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  354  2.9999999999999997e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3358  hypothetical protein  33.54 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4363  hypothetical protein  39.13 
 
 		 183 aa  82  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104876  normal  0.566874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3359  hypothetical protein  37.84 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3576  hypothetical protein  33.11 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4231  hypothetical protein  33.11 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2057  hypothetical protein  35.29 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.689095  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4436  hypothetical protein  26.92 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4001  hypothetical protein  34.68 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0372  hypothetical protein  29.7 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  33.73 
 
 		 1016 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  33.73 
 
 		 1016 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3578  hypothetical protein  29.47 
 
 		 387 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4229  hypothetical protein  29.47 
 
 		 387 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  30.38 
 
 		 137 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>