14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3358 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3358  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4363  hypothetical protein  54.89 
 
 		 183 aa  205  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104876  normal  0.566874 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2057  hypothetical protein  44.37 
 
 		 143 aa  139  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.689095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3576  hypothetical protein  42.37 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4231  hypothetical protein  42.37 
 
 		 177 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2918  hypothetical protein  33.54 
 
 		 171 aa  85.9  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3359  hypothetical protein  37.93 
 
 		 183 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4001  hypothetical protein  35.14 
 
 		 193 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4436  hypothetical protein  27.74 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0372  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0026  hypothetical protein  25.93 
 
 		 169 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0278  conserved hypothetical cytosolic protein  31.65 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.472545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4660  Domain of unknown function DUF1863  24.78 
 
 		 155 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  28.16 
 
 		 2159 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.932976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>