17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3359 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3359  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4436  hypothetical protein  51.81 
 
 
197 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3576  hypothetical protein  42.86 
 
 
177 aa  153  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4231  hypothetical protein  42.86 
 
 
177 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4001  hypothetical protein  41.36 
 
 
193 aa  121  7e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0372  hypothetical protein  46.3 
 
 
180 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3358  hypothetical protein  37.93 
 
 
179 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4363  hypothetical protein  40.52 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104876  normal  0.566874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2918  hypothetical protein  37.84 
 
 
171 aa  78.2  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0571  hypothetical protein  38.1 
 
 
399 aa  68.2  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.039235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2057  hypothetical protein  36.52 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.689095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3581  hypothetical protein  27.01 
 
 
286 aa  58.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4227  hypothetical protein  26.76 
 
 
391 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0278  conserved hypothetical cytosolic protein  30.7 
 
 
157 aa  51.6  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.472545  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0026  hypothetical protein  28.57 
 
 
169 aa  49.3  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2060  hypothetical protein  26.26 
 
 
247 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528414  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1906  hypothetical protein  28.28 
 
 
203 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>