13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0372 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0372  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3359  hypothetical protein  46.3 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4436  hypothetical protein  46.3 
 
 		 197 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3576  hypothetical protein  51.43 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4231  hypothetical protein  51.43 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4001  hypothetical protein  35.9 
 
 		 193 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4363  hypothetical protein  33.98 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104876  normal  0.566874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3358  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0571  hypothetical protein  38.55 
 
 		 399 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.039235  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2057  hypothetical protein  35.24 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.689095  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3581  hypothetical protein  34.29 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4227  hypothetical protein  35.05 
 
 		 391 aa  58.5  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2918  hypothetical protein  29.7 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>