19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3576 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3576  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4231  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4001  hypothetical protein  43.39 
 
 		 193 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.851942 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3359  hypothetical protein  42.86 
 
 		 183 aa  153  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4436  hypothetical protein  43.88 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0372  hypothetical protein  51.43 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4363  hypothetical protein  41.86 
 
 		 183 aa  90.1  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104876  normal  0.566874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3358  hypothetical protein  42.37 
 
 		 179 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2918  hypothetical protein  33.11 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2057  hypothetical protein  37.72 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.689095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4227  hypothetical protein  30.77 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3581  hypothetical protein  30.77 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0571  hypothetical protein  30.17 
 
 		 399 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.039235  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0026  hypothetical protein  39.24 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2060  hypothetical protein  32.71 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.528414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0278  conserved hypothetical cytosolic protein  28.95 
 
 		 157 aa  51.6  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.472545  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.58 
 
 		 880 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.58 
 
 		 880 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  30.21 
 
 		 291 aa  41.2  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>