13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0278 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0278  conserved hypothetical cytosolic protein  100 
 
 		 157 aa  327  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.472545  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0026  hypothetical protein  34.16 
 
 		 169 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4660  Domain of unknown function DUF1863  33.33 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4695  hypothetical protein  26.45 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4956  hypothetical protein  24.52 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564772 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3576  hypothetical protein  28.95 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3359  hypothetical protein  30.7 
 
 		 183 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4231  hypothetical protein  28.95 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  32.56 
 
 		 331 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  31.93 
 
 		 441 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3358  hypothetical protein  31.65 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4363  hypothetical protein  34.15 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.104876  normal  0.566874 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  30 
 
 		 404 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>