197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0235 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  100 
 
 
433 aa  902    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  67.84 
 
 
438 aa  629  1e-179  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  67.84 
 
 
438 aa  627  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  62.01 
 
 
464 aa  568  1e-161  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  48.13 
 
 
438 aa  442  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  47.33 
 
 
437 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  47.32 
 
 
437 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  45.31 
 
 
444 aa  393  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  45.54 
 
 
442 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  42.76 
 
 
455 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  45.94 
 
 
424 aa  378  1e-103  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  41.99 
 
 
456 aa  373  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  42.41 
 
 
459 aa  371  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  41.31 
 
 
460 aa  363  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  43.97 
 
 
458 aa  359  4e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  41.58 
 
 
379 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  36.26 
 
 
399 aa  235  1.0000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  34.52 
 
 
398 aa  229  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  31.96 
 
 
393 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  32.49 
 
 
445 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  28.71 
 
 
425 aa  189  9e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  31.82 
 
 
423 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  28.86 
 
 
437 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  28.57 
 
 
437 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  30.53 
 
 
421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  27.14 
 
 
431 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  27.69 
 
 
411 aa  171  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  28.45 
 
 
410 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  26.61 
 
 
405 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  30.1 
 
 
407 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  28.43 
 
 
432 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  27.4 
 
 
411 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  26.92 
 
 
411 aa  157  4e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  25.07 
 
 
409 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  28.21 
 
 
432 aa  146  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  27.58 
 
 
429 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  27.62 
 
 
429 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  27.12 
 
 
440 aa  143  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  27.62 
 
 
473 aa  143  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  26.91 
 
 
411 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  26.83 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  26.56 
 
 
432 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  27.14 
 
 
432 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  26.04 
 
 
413 aa  140  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  27.88 
 
 
423 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  27.88 
 
 
429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  26.44 
 
 
429 aa  136  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  29.87 
 
 
370 aa  136  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  27.14 
 
 
423 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  26.67 
 
 
424 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  25.74 
 
 
426 aa  133  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  27.14 
 
 
423 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  27.3 
 
 
415 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  28.97 
 
 
427 aa  130  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  25.55 
 
 
426 aa  129  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  29.19 
 
 
412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  26.15 
 
 
432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  25.55 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  28.53 
 
 
422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  26.37 
 
 
425 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.13 
 
 
409 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  26.78 
 
 
422 aa  124  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  25.25 
 
 
424 aa  123  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  25.72 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  25.72 
 
 
417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.32 
 
 
412 aa  118  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  25.9 
 
 
430 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  26.78 
 
 
425 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  26.5 
 
 
425 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  23.98 
 
 
426 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  23.98 
 
 
426 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  26.5 
 
 
439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  26.04 
 
 
431 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  26.33 
 
 
430 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  23.98 
 
 
426 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  23.98 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  26.78 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  24.25 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  24.25 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  24.25 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.15 
 
 
428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  24.31 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.36 
 
 
418 aa  110  5e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  23.5 
 
 
426 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  24.31 
 
 
427 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.31 
 
 
427 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  25.7 
 
 
429 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.14 
 
 
399 aa  109  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.06 
 
 
417 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  25 
 
 
427 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  24.06 
 
 
422 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  25.12 
 
 
436 aa  108  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  24.43 
 
 
412 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.37 
 
 
413 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  25.12 
 
 
432 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  25.12 
 
 
436 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.18 
 
 
413 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  23.82 
 
 
427 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  26.21 
 
 
425 aa  106  8e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  22.72 
 
 
410 aa  105  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>