195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_17241 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  98.39 
 
 
437 aa  873    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  100 
 
 
437 aa  888    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  52.36 
 
 
405 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  48.56 
 
 
431 aa  420  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  47.17 
 
 
410 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  47.42 
 
 
411 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  48.17 
 
 
411 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  47.17 
 
 
411 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  43.95 
 
 
425 aa  359  5e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  43.61 
 
 
421 aa  345  7e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  30.94 
 
 
438 aa  179  8e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  28.57 
 
 
433 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  31.48 
 
 
456 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  30.73 
 
 
460 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  29.83 
 
 
455 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  30.22 
 
 
459 aa  166  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  28.92 
 
 
464 aa  165  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  26.99 
 
 
438 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  26.99 
 
 
438 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  29.51 
 
 
399 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  29.95 
 
 
398 aa  160  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  27.79 
 
 
393 aa  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  29.5 
 
 
444 aa  150  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  29.58 
 
 
437 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  29.18 
 
 
437 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  27.54 
 
 
423 aa  143  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  25.91 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  26.55 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  27.08 
 
 
442 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  26.8 
 
 
379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  24.56 
 
 
409 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  27.49 
 
 
407 aa  123  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  25.76 
 
 
439 aa  122  9e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  26.13 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.66 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  24.05 
 
 
418 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  28.24 
 
 
429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.64 
 
 
417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.65 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.73 
 
 
413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.65 
 
 
413 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  28.53 
 
 
412 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  27.25 
 
 
425 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.44 
 
 
413 aa  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  28.61 
 
 
440 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.43 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.43 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.43 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.42 
 
 
412 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  25.32 
 
 
430 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  23.53 
 
 
431 aa  110  5e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  23.24 
 
 
418 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  23.24 
 
 
418 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  23.24 
 
 
418 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.93 
 
 
413 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  28.5 
 
 
425 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  25.3 
 
 
426 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  25.43 
 
 
426 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  26.22 
 
 
430 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  23.24 
 
 
418 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.86 
 
 
411 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  25.43 
 
 
426 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  25.68 
 
 
426 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  23.24 
 
 
418 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  27.5 
 
 
426 aa  108  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  23.24 
 
 
418 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  24.43 
 
 
433 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.93 
 
 
413 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  23.48 
 
 
425 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  23.68 
 
 
417 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  23.2 
 
 
425 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  29.91 
 
 
424 aa  106  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  24.59 
 
 
420 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  24.59 
 
 
420 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  23.69 
 
 
425 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  25.43 
 
 
426 aa  106  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  26.16 
 
 
423 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  23.76 
 
 
432 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  25.5 
 
 
425 aa  104  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  22.98 
 
 
412 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  25.58 
 
 
445 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.82 
 
 
428 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  27.49 
 
 
422 aa  102  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  27.84 
 
 
423 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  25.64 
 
 
429 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  25.25 
 
 
427 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  27.03 
 
 
427 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  25 
 
 
427 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  24.62 
 
 
427 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  23.2 
 
 
431 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  25 
 
 
427 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  27.79 
 
 
429 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  26.37 
 
 
425 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  25.59 
 
 
431 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  26.85 
 
 
429 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  26.14 
 
 
429 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  25 
 
 
422 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  25 
 
 
427 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  27.87 
 
 
424 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  24.37 
 
 
427 aa  100  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>