196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1538 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  100 
 
 
421 aa  831    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  63.73 
 
 
425 aa  514  1e-144  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  46.42 
 
 
431 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  52.75 
 
 
405 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  42.09 
 
 
410 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  43.86 
 
 
437 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  43.61 
 
 
437 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  41.56 
 
 
411 aa  354  2e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  41.56 
 
 
411 aa  351  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  40.83 
 
 
411 aa  340  2e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  30.62 
 
 
433 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  33.99 
 
 
438 aa  189  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  28.5 
 
 
438 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  29.41 
 
 
464 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  28.5 
 
 
438 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  32.84 
 
 
437 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  31.14 
 
 
437 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  31.83 
 
 
444 aa  171  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  32.39 
 
 
399 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  32.97 
 
 
442 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  31.71 
 
 
398 aa  166  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  29.75 
 
 
379 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  31.89 
 
 
460 aa  165  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  31.71 
 
 
459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  33.06 
 
 
456 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  31.42 
 
 
424 aa  162  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  32.5 
 
 
455 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  30.2 
 
 
393 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  29.51 
 
 
458 aa  146  8.000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  31.34 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  31.45 
 
 
445 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  29.46 
 
 
432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  31.51 
 
 
397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  27.84 
 
 
432 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  28.18 
 
 
407 aa  114  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  28.61 
 
 
429 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.93 
 
 
412 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  27.84 
 
 
429 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  25.71 
 
 
405 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  27.57 
 
 
429 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  25.2 
 
 
439 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  28.39 
 
 
425 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  28.75 
 
 
370 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  24.37 
 
 
418 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  23.29 
 
 
418 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  28.18 
 
 
423 aa  106  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  25.45 
 
 
405 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  28.49 
 
 
430 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  25.5 
 
 
412 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1112  Amidohydrolase 3  24.1 
 
 
419 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00316686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  31.53 
 
 
412 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  22.77 
 
 
413 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  30.48 
 
 
425 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  28.5 
 
 
424 aa  103  5e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  24.19 
 
 
409 aa  103  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  24.21 
 
 
433 aa  103  7e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  28.21 
 
 
430 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.06 
 
 
399 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  23.81 
 
 
417 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  30.16 
 
 
424 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  22.22 
 
 
413 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.42 
 
 
428 aa  100  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  21.04 
 
 
420 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  21.04 
 
 
420 aa  100  5e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  23.25 
 
 
418 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.12 
 
 
411 aa  100  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  23.25 
 
 
418 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  23.25 
 
 
418 aa  100  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.88 
 
 
413 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  23.25 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  23.25 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  23.25 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  29.44 
 
 
440 aa  99  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  28.36 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  27.35 
 
 
431 aa  98.2  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  25.93 
 
 
425 aa  98.6  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.88 
 
 
413 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  29.75 
 
 
429 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  24 
 
 
426 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  28.13 
 
 
423 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  24 
 
 
426 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  24 
 
 
426 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  24.25 
 
 
426 aa  98.2  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.34 
 
 
413 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  28.18 
 
 
473 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  22.49 
 
 
417 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.05 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.05 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  22.78 
 
 
413 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  22.69 
 
 
413 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  26.36 
 
 
422 aa  97.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  29.62 
 
 
399 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  25.53 
 
 
400 aa  97.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  24 
 
 
426 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.58 
 
 
413 aa  96.3  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  27.23 
 
 
426 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  28.05 
 
 
427 aa  95.5  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  22.41 
 
 
412 aa  93.6  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  25.27 
 
 
422 aa  93.6  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  28.57 
 
 
423 aa  93.2  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>