198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_14901 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  86.86 
 
 
411 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  92.93 
 
 
411 aa  755    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  100 
 
 
411 aa  837    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  71.22 
 
 
410 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  48.16 
 
 
437 aa  394  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  47.42 
 
 
437 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  41.75 
 
 
431 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  42.36 
 
 
405 aa  348  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  39.8 
 
 
425 aa  345  7e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  41.56 
 
 
421 aa  335  7e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  29.64 
 
 
438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  30.62 
 
 
464 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  29.38 
 
 
438 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  27.69 
 
 
433 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 
399 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  27.88 
 
 
438 aa  166  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  26.78 
 
 
456 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  27.11 
 
 
460 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  27.54 
 
 
398 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  25.55 
 
 
459 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  26.7 
 
 
455 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  29.12 
 
 
379 aa  152  8e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  27.6 
 
 
424 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  27.46 
 
 
437 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  30.06 
 
 
444 aa  147  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  27.2 
 
 
437 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  27.91 
 
 
423 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  26.67 
 
 
393 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  24.55 
 
 
458 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  25.45 
 
 
442 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  28.01 
 
 
425 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  26.68 
 
 
430 aa  123  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  25.59 
 
 
409 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  26.42 
 
 
430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  25.76 
 
 
445 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  26.44 
 
 
423 aa  120  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  26.53 
 
 
425 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  25.88 
 
 
429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  26.28 
 
 
426 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  26.63 
 
 
432 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  26.65 
 
 
424 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  26.02 
 
 
429 aa  116  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  26.02 
 
 
423 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  26.91 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.37 
 
 
418 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  26.99 
 
 
424 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  25.06 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.06 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  27.09 
 
 
427 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  26.34 
 
 
432 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  26.8 
 
 
440 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  26.98 
 
 
431 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  25.48 
 
 
427 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  25.33 
 
 
427 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  25.06 
 
 
427 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  25.06 
 
 
427 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  25.06 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  26.3 
 
 
429 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  25.06 
 
 
427 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  27.32 
 
 
429 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  25.61 
 
 
423 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  27.46 
 
 
429 aa  107  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  24.03 
 
 
412 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  25.47 
 
 
433 aa  107  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  24.75 
 
 
407 aa  106  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  26.37 
 
 
415 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  26.88 
 
 
422 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  25.41 
 
 
426 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  26.88 
 
 
422 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  25.36 
 
 
425 aa  103  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  24.63 
 
 
423 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  24.63 
 
 
423 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  25.07 
 
 
425 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  25.72 
 
 
436 aa  102  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  25.72 
 
 
436 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  25.72 
 
 
432 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  25.86 
 
 
422 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.79 
 
 
412 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  25.07 
 
 
425 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  26.12 
 
 
412 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  23.53 
 
 
418 aa  99.8  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  27.21 
 
 
370 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  23.35 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  23.35 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  23.35 
 
 
418 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  26.96 
 
 
439 aa  99  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.93 
 
 
413 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  24.87 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  24.87 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  23.1 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  23.1 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  23.1 
 
 
418 aa  96.7  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  24.87 
 
 
426 aa  96.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.6 
 
 
413 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  24.6 
 
 
426 aa  96.3  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  25.42 
 
 
432 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  24.87 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  23.58 
 
 
409 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  24.2 
 
 
431 aa  94.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  22.85 
 
 
406 aa  93.6  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>