199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_15031 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  89.02 
 
 
411 aa  721    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  100 
 
 
411 aa  835    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  92.93 
 
 
411 aa  779    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  72.26 
 
 
410 aa  618  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  48.9 
 
 
437 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  48.17 
 
 
437 aa  393  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  40.62 
 
 
425 aa  347  2e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  42.11 
 
 
405 aa  345  8e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  40.5 
 
 
431 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  40.83 
 
 
421 aa  335  1e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  28.69 
 
 
399 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  29.31 
 
 
438 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  29.31 
 
 
438 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  26.92 
 
 
433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  30.42 
 
 
464 aa  166  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  28.61 
 
 
438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  26.29 
 
 
456 aa  162  1e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  26.95 
 
 
398 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  26.57 
 
 
460 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  25.06 
 
 
459 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  26.2 
 
 
455 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  27.08 
 
 
424 aa  149  8e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  28.69 
 
 
379 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  27.18 
 
 
437 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  29.6 
 
 
444 aa  144  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  27.91 
 
 
423 aa  143  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  26.99 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  25.87 
 
 
393 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  23.79 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  23.41 
 
 
442 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  26.98 
 
 
409 aa  124  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  28.01 
 
 
425 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  25.42 
 
 
445 aa  120  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  26.22 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  26.15 
 
 
423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  26.4 
 
 
424 aa  113  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  26.15 
 
 
430 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.56 
 
 
418 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.950648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  26.53 
 
 
425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  27.25 
 
 
424 aa  111  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  25.58 
 
 
427 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.58 
 
 
427 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  25.88 
 
 
430 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  25.86 
 
 
427 aa  110  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  25.58 
 
 
427 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  25.58 
 
 
427 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  25.58 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  26.03 
 
 
427 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  25.61 
 
 
429 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  25.19 
 
 
407 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  25.58 
 
 
427 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  25.98 
 
 
426 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  26.22 
 
 
427 aa  107  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  26.08 
 
 
432 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  25.45 
 
 
423 aa  106  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  25.67 
 
 
433 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  27.65 
 
 
439 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  25.81 
 
 
431 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  25.27 
 
 
429 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  25.97 
 
 
440 aa  104  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  25.5 
 
 
432 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  25.97 
 
 
415 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  27.46 
 
 
429 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  24.8 
 
 
423 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  26.13 
 
 
422 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  27.27 
 
 
422 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  25.43 
 
 
423 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  25.91 
 
 
436 aa  100  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  25.91 
 
 
432 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  25.91 
 
 
436 aa  100  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  26.44 
 
 
429 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  23.37 
 
 
406 aa  99.8  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.79 
 
 
412 aa  99.8  9e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  22.89 
 
 
413 aa  99.8  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  22.74 
 
 
432 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  24.8 
 
 
426 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  25.19 
 
 
423 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  25.65 
 
 
425 aa  99.4  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  23 
 
 
412 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  25.57 
 
 
429 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  25.94 
 
 
422 aa  96.7  6e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  26.26 
 
 
426 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  26.26 
 
 
426 aa  96.3  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  22.74 
 
 
411 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  26.26 
 
 
426 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  25.99 
 
 
426 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  26.38 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.67 
 
 
428 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  26.26 
 
 
426 aa  94.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.63 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  24.78 
 
 
425 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  24.78 
 
 
425 aa  94  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  23.5 
 
 
431 aa  93.2  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  25.14 
 
 
432 aa  93.2  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  21.93 
 
 
418 aa  93.2  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  22.34 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  22.34 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  22.34 
 
 
418 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  23.81 
 
 
409 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  23.3 
 
 
413 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>