202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4666 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  100 
 
 		 437 aa  884    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  81.24 
 
 		 437 aa  737    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  65.98 
 
 		 444 aa  583  1.0000000000000001e-165  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  48.86 
 
 		 464 aa  423  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  47.32 
 
 		 433 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  55.65 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  49.77 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  46.35 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  46.35 
 
 		 438 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  49.29 
 
 		 458 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  47.98 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  47.67 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  48.77 
 
 		 459 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  48.31 
 
 		 455 aa  369  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  46.21 
 
 		 460 aa  353  4e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  42.11 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  38.12 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  36.09 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  34.88 
 
 		 393 aa  223  4e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  37.18 
 
 		 445 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  34.25 
 
 		 407 aa  182  9.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  34.48 
 
 		 425 aa  179  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  35.62 
 
 		 423 aa  169  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  31.2 
 
 		 421 aa  166  9e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  28.85 
 
 		 437 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  28.93 
 
 		 437 aa  154  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  27.2 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.5 
 
 		 412 aa  150  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  34.53 
 
 		 412 aa  149  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  27.9 
 
 		 431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  26.42 
 
 		 410 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  28.02 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  30.08 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  29.4 
 
 		 429 aa  144  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  29.85 
 
 		 426 aa  143  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  29.01 
 
 		 440 aa  142  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  29.44 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  30.07 
 
 		 429 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  26.11 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  30.46 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  29.06 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  29.93 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  29.98 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  26.99 
 
 		 411 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.64 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  29.8 
 
 		 432 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  32.37 
 
 		 425 aa  137  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  30.53 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  30.53 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  30.05 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  27.27 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  26.76 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  26 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  26 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  28.34 
 
 		 432 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5700  Cytosine deaminase  30.26 
 
 		 415 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  29.01 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  26.49 
 
 		 439 aa  133  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  30.1 
 
 		 431 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  26.59 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  25.96 
 
 		 426 aa  131  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  25.96 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  25.96 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  25.96 
 
 		 426 aa  131  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  26.34 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  26.34 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  26.59 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  28.71 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  31.72 
 
 		 370 aa  129  7.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  27.16 
 
 		 412 aa  129  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  25.18 
 
 		 436 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  25.18 
 
 		 436 aa  129  9.000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  26.1 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.1 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  25.24 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  26.55 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  26.1 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  25.81 
 
 		 426 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  26.1 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.11 
 
 		 411 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  25.43 
 
 		 425 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  28.01 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  26.85 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  27.1 
 
 		 425 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.94 
 
 		 413 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  26.6 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  26.93 
 
 		 426 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  28.31 
 
 		 405 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  30.43 
 
 		 425 aa  124  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  29.49 
 
 		 436 aa  123  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  27.64 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  24.82 
 
 		 431 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.13 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  30.18 
 
 		 425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  27.47 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.11 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  27.25 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  29.92 
 
 		 425 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.76 
 
 		 413 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>