197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0854 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  100 
 
 		 425 aa  839    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  63.73 
 
 		 421 aa  496  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  53.27 
 
 		 405 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  47.28 
 
 		 431 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  40 
 
 		 410 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  43.95 
 
 		 437 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  43.95 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  39.8 
 
 		 411 aa  345  7e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  39.71 
 
 		 411 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  40.62 
 
 		 411 aa  333  3e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  33.43 
 
 		 464 aa  190  5e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  28.71 
 
 		 433 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  28.85 
 
 		 438 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  33.52 
 
 		 438 aa  184  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  28.36 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  31.69 
 
 		 379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  32.69 
 
 		 437 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  33.78 
 
 		 456 aa  169  9e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  34.48 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  31.46 
 
 		 460 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  34.67 
 
 		 455 aa  167  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  34.53 
 
 		 442 aa  166  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  33.33 
 
 		 459 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  31.62 
 
 		 393 aa  163  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  29.27 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  30.09 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  32.22 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  30.29 
 
 		 399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  31.97 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  32.66 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  29.53 
 
 		 432 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  31.06 
 
 		 445 aa  123  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  25.71 
 
 		 409 aa  123  7e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  26.69 
 
 		 439 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  27.91 
 
 		 418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  32.47 
 
 		 424 aa  114  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.17 
 
 		 399 aa  113  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  30.42 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  27.22 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  26.16 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  28.32 
 
 		 425 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.36 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  31.17 
 
 		 425 aa  107  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.64 
 
 		 412 aa  106  8e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  26.45 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1112  Amidohydrolase 3  24.29 
 
 		 419 aa  106  9e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00316686  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  23.64 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  23.64 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  26.45 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  26.45 
 
 		 418 aa  106  9e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  26.16 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  26.16 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  26.16 
 
 		 418 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  28.1 
 
 		 429 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  26.72 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  23.63 
 
 		 418 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  25.87 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  26.58 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  28.05 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  28.09 
 
 		 429 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.42 
 
 		 413 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.72 
 
 		 411 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.74 
 
 		 413 aa  103  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  25.73 
 
 		 426 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  27.51 
 
 		 405 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.16 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.45 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  27.53 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.36 
 
 		 413 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  25.73 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  28.24 
 
 		 425 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  25.73 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.16 
 
 		 413 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  23.55 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  28.79 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  25.88 
 
 		 426 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  31.96 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  27.78 
 
 		 405 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.87 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.87 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  29.78 
 
 		 397 aa  100  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  25.73 
 
 		 426 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.78 
 
 		 413 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  29.81 
 
 		 370 aa  99.8  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  26.32 
 
 		 427 aa  99.8  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  26.32 
 
 		 427 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.45 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  24.4 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  25.58 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  26.32 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  26.72 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  29.87 
 
 		 432 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.5 
 
 		 417 aa  98.6  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  29.25 
 
 		 440 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  26.04 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.04 
 
 		 427 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  26.04 
 
 		 427 aa  97.1  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  26.04 
 
 		 427 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  25.73 
 
 		 423 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  28.75 
 
 		 423 aa  96.3  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>