183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3052 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  100 
 
 		 423 aa  831    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  44.76 
 
 		 393 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  39.37 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  36.41 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  35.34 
 
 		 445 aa  186  6e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  31.82 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  31.23 
 
 		 438 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  31.23 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  32.7 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  32.7 
 
 		 379 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  34.3 
 
 		 437 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  33.43 
 
 		 464 aa  173  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  33.04 
 
 		 458 aa  169  8e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  34.34 
 
 		 460 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  34.56 
 
 		 455 aa  163  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  35.71 
 
 		 424 aa  161  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  34.21 
 
 		 456 aa  160  4e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  35.62 
 
 		 437 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  36.36 
 
 		 459 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  35 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  29.5 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  32.84 
 
 		 405 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  30.7 
 
 		 431 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  27.91 
 
 		 411 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  27.54 
 
 		 437 aa  143  6e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  27.43 
 
 		 437 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  31.16 
 
 		 438 aa  141  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  28 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  33.54 
 
 		 473 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  32.66 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  26.78 
 
 		 411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  30.33 
 
 		 406 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  27.91 
 
 		 411 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  38.31 
 
 		 412 aa  129  7.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  30 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  31.15 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  31.15 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  31.15 
 
 		 418 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  31.42 
 
 		 418 aa  124  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  30.84 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  30.84 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  30.84 
 
 		 418 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  31.14 
 
 		 407 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  30 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  29.91 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  28.45 
 
 		 426 aa  117  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  30.87 
 
 		 417 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  28.45 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  28.45 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  28.44 
 
 		 433 aa  116  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.49 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  27.72 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.43 
 
 		 413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  28.09 
 
 		 426 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  28.09 
 
 		 439 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  27.89 
 
 		 426 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  29.87 
 
 		 432 aa  113  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  29.87 
 
 		 436 aa  113  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  29.87 
 
 		 436 aa  113  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.03 
 
 		 413 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.94 
 
 		 413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  30.16 
 
 		 425 aa  112  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  28.3 
 
 		 422 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.01 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.01 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  30.49 
 
 		 432 aa  111  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.97 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.43 
 
 		 413 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  30.9 
 
 		 427 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  25.07 
 
 		 425 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.65 
 
 		 428 aa  109  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  28.48 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.48 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  27.86 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.43 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.39 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  28.48 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  27.86 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  28.48 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  28.4 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  28.48 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  28.48 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  25.56 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  25.53 
 
 		 413 aa  107  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  28.96 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  23.44 
 
 		 418 aa  107  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  27.02 
 
 		 425 aa  107  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.41 
 
 		 413 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.61 
 
 		 412 aa  107  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.76 
 
 		 411 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  25.71 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  25.71 
 
 		 420 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  25.87 
 
 		 431 aa  106  9e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  29.49 
 
 		 432 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  25.96 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  26.65 
 
 		 431 aa  104  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  26.48 
 
 		 410 aa  103  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  27.9 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  27.9 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  28.49 
 
 		 429 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>