195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5410 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  100 
 
 		 460 aa  919    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  57.58 
 
 		 456 aa  478  1e-133  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  59.45 
 
 		 455 aa  478  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  58.92 
 
 		 459 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  42.86 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  41.31 
 
 		 433 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  45.45 
 
 		 438 aa  356  3.9999999999999996e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  47.49 
 
 		 442 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  44.77 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  46.21 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  39.36 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  39.36 
 
 		 438 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  42.57 
 
 		 444 aa  327  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  42.53 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  40.55 
 
 		 458 aa  279  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  40.21 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  34.94 
 
 		 393 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  35.03 
 
 		 399 aa  193  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  35.77 
 
 		 398 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  31.46 
 
 		 425 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  30.73 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  32.1 
 
 		 407 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  30.08 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  34.34 
 
 		 423 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  27.11 
 
 		 411 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  34.14 
 
 		 445 aa  160  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  29.97 
 
 		 431 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  30.81 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  26.85 
 
 		 411 aa  146  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  26.57 
 
 		 411 aa  146  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  25 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  29.59 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  23.76 
 
 		 409 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.18 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  27.8 
 
 		 426 aa  123  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  29.13 
 
 		 432 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  27.63 
 
 		 426 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  27.8 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  27.63 
 
 		 426 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  27.8 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  27.63 
 
 		 426 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  27.63 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  24.65 
 
 		 413 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  28.71 
 
 		 423 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  29.02 
 
 		 432 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  27.8 
 
 		 427 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  27.8 
 
 		 427 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  27.56 
 
 		 427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.96 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  24.78 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  27.56 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.56 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  27.56 
 
 		 427 aa  113  7.000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  30.28 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  26.96 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  26.33 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  28.28 
 
 		 415 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  27.62 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  30.58 
 
 		 412 aa  110  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  26.6 
 
 		 426 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  27.65 
 
 		 440 aa  110  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  26.56 
 
 		 429 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  27.38 
 
 		 429 aa  110  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  27.3 
 
 		 423 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  28.57 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  25.51 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  25.68 
 
 		 431 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  26.03 
 
 		 412 aa  108  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  24.8 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  26.05 
 
 		 422 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  26.8 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  26.77 
 
 		 433 aa  107  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  26.44 
 
 		 432 aa  106  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  29.34 
 
 		 473 aa  106  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  28.03 
 
 		 429 aa  106  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  26.5 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.48 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  25.85 
 
 		 418 aa  104  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  27.23 
 
 		 423 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.45 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.21 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  28.19 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  25.55 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  25.55 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  25.55 
 
 		 418 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  27.91 
 
 		 429 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  26.14 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.63 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  25.35 
 
 		 425 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.5 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.63 
 
 		 413 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  25.31 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  25.31 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  25.31 
 
 		 418 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  26.02 
 
 		 432 aa  100  6e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  26.02 
 
 		 436 aa  100  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  26.02 
 
 		 436 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.63 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.63 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  26.87 
 
 		 432 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.253377 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>