201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1683 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 412 aa  789    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  39.91 
 
 		 473 aa  211  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  35.29 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  28.69 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  33.07 
 
 		 424 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  28.89 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  33.7 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  33.67 
 
 		 432 aa  153  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  28.64 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  33.09 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  28.89 
 
 		 464 aa  150  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  34.9 
 
 		 437 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  33.6 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  34.53 
 
 		 437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  33.42 
 
 		 393 aa  145  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  34.64 
 
 		 428 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  32.31 
 
 		 458 aa  143  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  30.97 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  30.77 
 
 		 412 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3745  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.74 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  33.33 
 
 		 422 aa  140  6e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0800  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.81 
 
 		 417 aa  139  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4038  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.49 
 
 		 413 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4328  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.49 
 
 		 413 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.361665 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4219  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.7 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286277  normal  0.906556 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  28.34 
 
 		 439 aa  138  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  30.22 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0341  cytosine deaminase  33.65 
 
 		 425 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  38.31 
 
 		 423 aa  135  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3193  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.2 
 
 		 413 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2527  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.23 
 
 		 413 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0148672  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  34.86 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  34.86 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  33.76 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  32.61 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  32.2 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0763  Cytosine deaminase  31.69 
 
 		 417 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.991086  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  34.86 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  34.86 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  34.86 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  34.86 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  30.6 
 
 		 429 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  30.49 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0584  Cytosine deaminase  26.3 
 
 		 410 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.507688  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  30.49 
 
 		 426 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  29.19 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1985  cytosine deaminase  33.89 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.457104 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4281  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.63 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.436998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.73 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  30.22 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.85 
 
 		 412 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  30.49 
 
 		 422 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  32.75 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  34.24 
 
 		 423 aa  133  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.14 
 
 		 413 aa  133  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  30.42 
 
 		 431 aa  133  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30170  Cytosine deaminase protein  34.47 
 
 		 412 aa  133  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.831905  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  31.33 
 
 		 429 aa  133  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  30.29 
 
 		 432 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  30.22 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  30.29 
 
 		 436 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  30.14 
 
 		 426 aa  133  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  30.29 
 
 		 436 aa  133  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1583  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.85 
 
 		 418 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.950648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  29.55 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.55 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  29.55 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  29.55 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  33.58 
 
 		 440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  29.55 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  29.55 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3189  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  32.58 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  29.55 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  30.1 
 
 		 429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  27.01 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2651  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  33.12 
 
 		 413 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  31.66 
 
 		 398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  34.5 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0955  cytosine deaminase  32.7 
 
 		 425 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.366628  normal  0.0736723 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  32.91 
 
 		 370 aa  129  9.000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  29.26 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  33.49 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  26.76 
 
 		 425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  29.7 
 
 		 438 aa  127  4.0000000000000003e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  31.53 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  32.98 
 
 		 400 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  28.04 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  28.53 
 
 		 431 aa  126  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  32.89 
 
 		 426 aa  126  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  28.01 
 
 		 432 aa  126  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  32.73 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  34.29 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  29.97 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  32.86 
 
 		 426 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  28.53 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  30.7 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  32.92 
 
 		 442 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  30.48 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  31.39 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0538  cytosine deaminase  31.39 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>