191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14651 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  100 
 
 
410 aa  830    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  71.22 
 
 
411 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  72.26 
 
 
411 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  72.44 
 
 
411 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  47.17 
 
 
437 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  47.17 
 
 
437 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  44.25 
 
 
431 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  40 
 
 
425 aa  364  2e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  42.09 
 
 
421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  43.12 
 
 
405 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  27.81 
 
 
399 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  27.64 
 
 
398 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  28.5 
 
 
438 aa  169  9e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  28.5 
 
 
438 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  28.45 
 
 
433 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  25.55 
 
 
456 aa  162  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  24.02 
 
 
459 aa  160  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  27.88 
 
 
464 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  24.07 
 
 
455 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  25.78 
 
 
438 aa  150  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  26.08 
 
 
424 aa  149  9e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  27.45 
 
 
379 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  25 
 
 
460 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  25.07 
 
 
393 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  28.74 
 
 
444 aa  144  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  26.42 
 
 
437 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  28 
 
 
423 aa  139  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  25.06 
 
 
458 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  26.87 
 
 
437 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  27.57 
 
 
409 aa  130  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  28.73 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  23.69 
 
 
442 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  27.3 
 
 
423 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  28.36 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  27.89 
 
 
425 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4995  cytosine deaminase  28.36 
 
 
423 aa  122  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630781  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  25.46 
 
 
445 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  25.56 
 
 
440 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  28.28 
 
 
432 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  26.92 
 
 
432 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3311  cytosine deaminase  26.45 
 
 
429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  26.42 
 
 
430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  27 
 
 
429 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  26.29 
 
 
424 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  26.53 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  26.39 
 
 
407 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  27.3 
 
 
426 aa  113  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  28.07 
 
 
424 aa  113  6e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  28.07 
 
 
429 aa  113  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  25.82 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.36 
 
 
412 aa  111  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3993  cytosine deaminase  27.14 
 
 
432 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.005353  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  25.35 
 
 
427 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  25.35 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  26.1 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  25.35 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  25.35 
 
 
427 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5276  cytosine deaminase  27.24 
 
 
370 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  27.22 
 
 
422 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  26.73 
 
 
422 aa  109  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  25.35 
 
 
427 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.35 
 
 
427 aa  108  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  25.88 
 
 
429 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  25.35 
 
 
427 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  25.35 
 
 
427 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  26.9 
 
 
428 aa  107  4e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  24.73 
 
 
412 aa  107  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1306  cytosine deaminase  25.42 
 
 
431 aa  106  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  25.46 
 
 
433 aa  106  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  23.42 
 
 
411 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  24.93 
 
 
439 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  26.39 
 
 
426 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  26.05 
 
 
425 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  25.48 
 
 
426 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  25.48 
 
 
426 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  25.48 
 
 
426 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0629  cytosine deaminase  25.23 
 
 
425 aa  103  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00419836  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  25.83 
 
 
425 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  25.21 
 
 
426 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  25.48 
 
 
426 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  25.14 
 
 
432 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  25.14 
 
 
436 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  25.44 
 
 
422 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  25.14 
 
 
436 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  21.11 
 
 
413 aa  100  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  23.4 
 
 
418 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0933  cytosine deaminase  24.71 
 
 
432 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.253377 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  23.47 
 
 
432 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2803  cytosine deaminase  24.62 
 
 
431 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189731  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  24.62 
 
 
432 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2187  cytosine deaminase  24.48 
 
 
431 aa  98.2  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  23.68 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  22.25 
 
 
411 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  22.83 
 
 
473 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  23.68 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  23.68 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  23.68 
 
 
418 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  24.93 
 
 
415 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  23.68 
 
 
418 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  23.68 
 
 
418 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>