190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4756 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4756  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 445 aa  880    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1979  cytosine deaminase-like protein  34.25 
 
 		 438 aa  209  6e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0895567 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5141  Amidohydrolase 3  40.18 
 
 		 399 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3872  amidohydrolase 3  39.38 
 
 		 393 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171195  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1474  cytosine deaminase-like protein  38.46 
 
 		 458 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.534855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1952  cytosine deaminase-like protein  33.98 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1675  cytosine deaminase-like protein  38.98 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00400409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1381  cytosine deaminase-like protein  37.64 
 
 		 424 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3139  amidohydrolase 3  41.86 
 
 		 398 aa  203  4e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.121806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2042  cytosine deaminase-like protein  38.92 
 
 		 455 aa  202  8e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.670818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1723  cytosine deaminase-like protein  38.34 
 
 		 459 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0568  cytosine deaminase-like protein  36.46 
 
 		 438 aa  199  6e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.322505  decreased coverage  0.00702757 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1091  cytosine deaminase-like protein  37.84 
 
 		 456 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.528531  normal  0.0465874 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42867  predicted protein  37.22 
 
 		 379 aa  196  6e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3553  cytosine deaminase-like protein  36.07 
 
 		 444 aa  196  7e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0802  cytosine deaminase-like protein  39.62 
 
 		 442 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.467933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0235  cytosine deaminase-like protein  32.49 
 
 		 433 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0654453 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4666  cytosine deaminase-like protein  37.18 
 
 		 437 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.69631 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3052  amidohydrolase  35.34 
 
 		 423 aa  186  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4570  cytosine deaminase-like protein  35.6 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.882556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5410  cytosine deaminase-like protein  34.14 
 
 		 460 aa  160  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0215382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  32.32 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0854  cytosine deaminase  31.06 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14901  putative cytosine deaminase  25.76 
 
 		 411 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.352726  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14651  putative cytosine deaminase  25.46 
 
 		 410 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.734084  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13521  putative cytosine deaminase  28.67 
 
 		 431 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  33.65 
 
 		 432 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3527  cytosine deaminase  30.21 
 
 		 426 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  30.21 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  30.21 
 
 		 426 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1538  cytosine deaminase  30.75 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  30.42 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  30.21 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  28.92 
 
 		 411 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  30.21 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1400  putative cytosine deaminase  25.76 
 
 		 411 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  29.83 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2103  Cytosine deaminase  30.82 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  31.33 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15031  putative cytosine deaminase  25.42 
 
 		 411 aa  110  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19891  putative cytosine deaminase  28.28 
 
 		 405 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.128983 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  29.39 
 
 		 427 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  29.66 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  29.66 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  31.99 
 
 		 415 aa  109  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  29.39 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  29.66 
 
 		 427 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  29.11 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  29.66 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.75 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4594  cytosine deaminase  29.57 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0410  cytosine deaminase  29.11 
 
 		 427 aa  106  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0870  putative cytosine deaminase  25.91 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0750  cytosine deaminase  25.6 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0737  cytosine deaminase  25.6 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.159604  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17241  putative cytosine deaminase  25.58 
 
 		 437 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.918771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  28.82 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  28.05 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2335  cytosine deaminase  27.2 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1120  cytosine deaminase  27.2 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1034  cytosine deaminase  27.2 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17260  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  31.29 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.295268  normal  0.784232 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1533  cytosine deaminase  29.55 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0603  cytosine deaminase  26.9 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.281671  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0864  cytosine deaminase  26.9 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1831  cytosine deaminase  26.9 
 
 		 418 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.226941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2598  cytosine deaminase  28.57 
 
 		 430 aa  99.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177516  normal  0.0252433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  27.74 
 
 		 425 aa  99.8  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.38 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  23.72 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  30.14 
 
 		 428 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0909  Amidohydrolase 3  23.51 
 
 		 418 aa  97.4  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0898622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  28.78 
 
 		 422 aa  97.4  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2210  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.24 
 
 		 413 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.365249 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1477  cytosine deaminase  29.04 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613678  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1683  Amidohydrolase 3  31.93 
 
 		 412 aa  95.9  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1639  cytosine deaminase  27.53 
 
 		 418 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.233761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3714  cytosine deaminase  26.4 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3221  cytosine deaminase  28.87 
 
 		 425 aa  95.1  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.497988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3955  cytosine deaminase  26.4 
 
 		 436 aa  95.5  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  29.18 
 
 		 440 aa  94.4  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  28.99 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  25.45 
 
 		 409 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  28.88 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0237  cytosine deaminase  26.79 
 
 		 432 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0011  cytosine deaminase-like protein  25.45 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  28.23 
 
 		 424 aa  94  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0828  cytosine deaminase  28.1 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1594  cytosine deaminase  29.04 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0777  Cytosine deaminase  25.61 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.364693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3779  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  24.66 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.199731  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  28.26 
 
 		 429 aa  91.3  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1853  cytosine deaminase  25 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0471494  hitchhiker  0.00000346653 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  29 
 
 		 426 aa  90.9  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  27.08 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5333  cytosine deaminase  28.14 
 
 		 432 aa  90.9  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3834  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 409 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.94343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000567  cytosine deaminase  24.71 
 
 		 425 aa  89.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717995  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05690  cytosine deaminase  27.95 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05319  cytosine deaminase  25.8 
 
 		 425 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>