251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_70120 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  97.42 
 
 		 387 aa  689    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  100 
 
 		 387 aa  734    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  83.02 
 
 		 382 aa  595  1e-169  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  73.61 
 
 		 381 aa  518  1e-146  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5329  major facilitator transporter  72.61 
 
 		 379 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0783792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5277  major facilitator family transporter  72.99 
 
 		 379 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5187  major facilitator transporter  72.99 
 
 		 379 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0310386 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0193  major facilitator transporter  73.8 
 
 		 379 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000634988 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48020  Major facilitator family transporter protein  72.15 
 
 		 377 aa  488  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0228  major facilitator transporter  67.98 
 
 		 382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0094  hypothetical protein  67.63 
 
 		 382 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4482  major facilitator transporter  43.21 
 
 		 386 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.726 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0702  major facilitator family transporter  41.87 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0736  major facilitator transporter  41.76 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0735  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 385 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.762648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 385 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  38.46 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0703  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 386 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0720  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 386 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0823919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0792  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0339  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0822  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.426653  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3915  major facilitator transporter  34.93 
 
 		 386 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0783  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 386 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.724774  normal  0.275511 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3898  major facilitator transporter  36.44 
 
 		 386 aa  183  6e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.506514 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  33.79 
 
 		 404 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  34.97 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2561  major facilitator transporter  34.18 
 
 		 386 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  34.94 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2053  transporter, putative  33.06 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3226  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.232754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0859  major facilitator family transporter  33.06 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.288984  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2691  putative transporter  33.06 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3172  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1919  major facilitator family transporter  33.06 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  33.59 
 
 		 413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4139  major facilitator superfamily MFS_1  33.62 
 
 		 392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3211  major facilitator family transporter  35.42 
 
 		 311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 402 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3575  major facilitator transporter  35.91 
 
 		 395 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4418  major facilitator transporter  34.81 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  34.81 
 
 		 389 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  31.7 
 
 		 394 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 397 aa  143  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  31.71 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  31.49 
 
 		 380 aa  139  7.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3861  major facilitator transporter  31.61 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  31.91 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4881  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.164966  normal  0.758142 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  30.3 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 394 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  30.3 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  29.68 
 
 		 394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  34.59 
 
 		 388 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1279  major facilitator transporter  29.81 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  33.55 
 
 		 375 aa  123  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6676  major facilitator transporter  34.01 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.518138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1384  major facilitator superfamily MFS_1  29.71 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.381678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1172  major facilitator transporter  26.34 
 
 		 412 aa  92.8  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2954  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 412 aa  92.4  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.126979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  25.8 
 
 		 381 aa  90.1  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5688  major facilitator superfamily MFS_1  27.15 
 
 		 418 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0510347  normal  0.192354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 436 aa  84.7  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  29.25 
 
 		 434 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  29.25 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  27.41 
 
 		 465 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1740  transporter, putative  25.2 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.138078  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5608  MFS family transporter  27.66 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 432 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0204  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64590  putative MFS transporter  27.22 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0510632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 430 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  28.65 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 432 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 473 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3408  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  28.36 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1380  MFS permease  25.58 
 
 		 410 aa  79.7  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.897204  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0739  major facilitator transporter  28.49 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000634429  hitchhiker  0.000161748 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0730  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000305807  hitchhiker  0.0000000180087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0709  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3645  major facilitator transporter  28.95 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000051219  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3013  major facilitator transporter  30.91 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.382215  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1681  putative transporter  24.93 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3989  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3353  major facilitator transporter  28.15 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00730717  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 418 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0644  major facilitator transporter  20.99 
 
 		 429 aa  77.4  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3661  MFS permease  25.63 
 
 		 427 aa  77  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  27.99 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>