83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_62430 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_62430  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  309  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5434  hypothetical protein  90.51 
 
 		 158 aa  261  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.452017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1471  protein-export membrane protein SecD  39.78 
 
 		 740 aa  66.2  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000674169 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1936  protein-export membrane protein SecD  37.89 
 
 		 759 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.609116  hitchhiker  0.000000107208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  35.23 
 
 		 530 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0627  protein-export membrane protein SecD  33.64 
 
 		 502 aa  56.2  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.57035  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  30 
 
 		 501 aa  54.7  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  35.16 
 
 		 457 aa  54.7  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  35 
 
 		 535 aa  54.7  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  37.63 
 
 		 526 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2945  hypothetical protein  33.04 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.718496  normal  0.0382051 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.09 
 
 		 853 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  29.29 
 
 		 531 aa  50.8  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  30.39 
 
 		 554 aa  50.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  29.58 
 
 		 534 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5169  protein-export membrane protein SecD  34.21 
 
 		 1029 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.84 
 
 		 844 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  30.1 
 
 		 554 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  28.3 
 
 		 525 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  30.1 
 
 		 554 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  29.36 
 
 		 554 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3596  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.89 
 
 		 996 aa  48.9  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.318172 
 
 
-
 
NC_002950  PG1762  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.73 
 
 		 981 aa  48.9  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  32.29 
 
 		 399 aa  48.5  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0026  preprotein translocase subunit SecD  29.91 
 
 		 638 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.943233  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  30.25 
 
 		 554 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  29.47 
 
 		 503 aa  47.8  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  30.95 
 
 		 524 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0079  protein-export membrane protein SecD  30.91 
 
 		 515 aa  47.4  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  31.3 
 
 		 533 aa  47.4  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  31.94 
 
 		 535 aa  47.4  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  31.13 
 
 		 622 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  35.06 
 
 		 535 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2197  preprotein translocase subunit SecD  29.21 
 
 		 419 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1908  preprotein translocase subunit SecD  29.21 
 
 		 419 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.154062  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  29.81 
 
 		 533 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1285  protein-export membrane protein SecD  34.48 
 
 		 423 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0952765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1123  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 416 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0013  preprotein translocase subunit SecD  30.21 
 
 		 624 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295061  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  34.41 
 
 		 532 aa  45.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0716  SecD/SecF family protein-export membrane protein  28.18 
 
 		 734 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000203356  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  31.78 
 
 		 512 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  30.84 
 
 		 473 aa  45.8  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  30.21 
 
 		 595 aa  45.1  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  32.56 
 
 		 534 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 410 aa  44.7  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  34.21 
 
 		 554 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6254  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.81 
 
 		 1055 aa  43.9  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2113  protein-export membrane protein SecD  34.52 
 
 		 584 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.94 
 
 		 856 aa  43.9  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  29.33 
 
 		 594 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  29.33 
 
 		 594 aa  43.5  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  30.49 
 
 		 537 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2738  protein-export membrane protein SecD  30.86 
 
 		 406 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3821  hypothetical protein  29.81 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.261758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  33.71 
 
 		 533 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  29.09 
 
 		 534 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1349  protein-export membrane protein SecD  36.59 
 
 		 997 aa  43.5  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.853966  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2256  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.66 
 
 		 991 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  29.21 
 
 		 532 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  31.19 
 
 		 538 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  29.17 
 
 		 619 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  35.71 
 
 		 533 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  31.18 
 
 		 534 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0625  preprotein translocase subunit SecD  30.77 
 
 		 415 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000418015  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  33.78 
 
 		 532 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  32.58 
 
 		 533 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  31.18 
 
 		 531 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1420  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  29.17 
 
 		 990 aa  42.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.469149  normal  0.319601 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  32.29 
 
 		 526 aa  42  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  28.87 
 
 		 614 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1996  protein-export membrane protein SecD  27.87 
 
 		 670 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.391205  normal  0.0633632 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0096  hypothetical protein  28.41 
 
 		 490 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3464  protein-export membrane protein SecD  35.37 
 
 		 849 aa  41.6  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.068989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  32.93 
 
 		 617 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  32.35 
 
 		 533 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2315  preprotein translocase subunit SecD  34.15 
 
 		 598 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534551  normal  0.509852 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2323  preprotein translocase subunit SecD  34.15 
 
 		 598 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388488  normal  0.491542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2276  preprotein translocase subunit SecD  34.15 
 
 		 598 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 532 aa  40.8  0.008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  31.52 
 
 		 532 aa  40.8  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4393  hypothetical protein  43.86 
 
 		 211 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  29.73 
 
 		 607 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>