22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4393 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4393  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  401  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2566  hypothetical protein  32.1 
 
 		 304 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1239  hypothetical protein  28.65 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857721  normal  0.0239847 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  32 
 
 		 403 aa  47  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  38.6 
 
 		 531 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1942  protein-export membrane protein SecD  28.99 
 
 		 538 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0269026  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3212  preprotein translocase subunit SecD  34.52 
 
 		 470 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.718211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2884  preprotein translocase subunit SecD  34.52 
 
 		 470 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1695  protein-export membrane protein SecD  27.54 
 
 		 632 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  32.39 
 
 		 853 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  41.82 
 
 		 551 aa  44.7  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  38.6 
 
 		 535 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0096  hypothetical protein  33.85 
 
 		 490 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3816  preprotein translocase subunit SecD  28.41 
 
 		 617 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258625  normal  0.421333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  36.76 
 
 		 844 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3221  preprotein translocase subunit SecD  33.33 
 
 		 296 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.282272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  29.69 
 
 		 533 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3174  protein-export membrane protein SecD  29.58 
 
 		 566 aa  43.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.761403  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1356  preprotein translocase subunit SecD  35.09 
 
 		 410 aa  42.7  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.066873  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  38.18 
 
 		 532 aa  42  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  33.33 
 
 		 399 aa  41.6  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13980  protein-export membrane protein SecD  31.25 
 
 		 661 aa  41.6  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>