76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_13471 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_13471  AEC family transporter  100 
 
 
261 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1276  ABC transporter  67.98 
 
 
261 aa  327  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13681  AEC family transporter  69.77 
 
 
261 aa  300  1e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.02494  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13761  AEC family transporter  70.04 
 
 
261 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  39.3 
 
 
307 aa  179  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  39.37 
 
 
305 aa  165  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  38.67 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  38.67 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0852  AEC family transporter  35.71 
 
 
290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.670822  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1803  AEC family transporter  36.9 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  26.7 
 
 
312 aa  69.7  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.19 
 
 
306 aa  65.5  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  27.7 
 
 
306 aa  63.5  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  26.83 
 
 
315 aa  60.5  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 
307 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  22.01 
 
 
297 aa  55.1  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  27.23 
 
 
329 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  28.63 
 
 
301 aa  54.7  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.07 
 
 
313 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  23.38 
 
 
315 aa  53.5  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.7 
 
 
325 aa  53.1  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.12 
 
 
305 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  26.94 
 
 
308 aa  52.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  25.55 
 
 
320 aa  52.4  0.000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  27.68 
 
 
313 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.23 
 
 
361 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  25.1 
 
 
313 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  29.46 
 
 
313 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.64 
 
 
315 aa  50.8  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  25.58 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  26.56 
 
 
310 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  29.46 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.12 
 
 
302 aa  50.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.11 
 
 
307 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.89 
 
 
316 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  30.36 
 
 
313 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  22.69 
 
 
307 aa  49.7  0.00005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  29.46 
 
 
313 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  26.57 
 
 
306 aa  49.3  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  22.86 
 
 
299 aa  48.9  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  27.62 
 
 
316 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.54 
 
 
322 aa  48.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  21.84 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 
297 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.4 
 
 
304 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  28.69 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  24.22 
 
 
312 aa  46.2  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  37.74 
 
 
295 aa  46.2  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  25.89 
 
 
316 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  22.82 
 
 
312 aa  45.4  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  26.05 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  30.77 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  24.76 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  30.97 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  30.97 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  27.43 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  32.29 
 
 
322 aa  44.3  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  30.09 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  23.81 
 
 
298 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  24.44 
 
 
325 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  30.97 
 
 
318 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  27.91 
 
 
321 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  30.09 
 
 
318 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  26.36 
 
 
299 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  25.68 
 
 
310 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  29.2 
 
 
318 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  24.14 
 
 
319 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.33 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0068  Auxin Efflux Carrier  29.87 
 
 
302 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.723406  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  30.09 
 
 
318 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  30.09 
 
 
318 aa  42.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 
324 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.11 
 
 
332 aa  42.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.39 
 
 
304 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  26.74 
 
 
316 aa  42.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  29.2 
 
 
318 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>