162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2660 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 319 aa  620  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  87.46 
 
 		 319 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  62.03 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  63.92 
 
 		 318 aa  364  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  59.49 
 
 		 299 aa  354  1e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  61.64 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  61.36 
 
 		 311 aa  347  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  60.06 
 
 		 311 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  52.26 
 
 		 321 aa  325  9e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  52.75 
 
 		 321 aa  324  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  52.41 
 
 		 321 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  55.56 
 
 		 322 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  58.18 
 
 		 321 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  54.92 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  54.6 
 
 		 322 aa  318  9e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  54.29 
 
 		 322 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  54.29 
 
 		 322 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  54.29 
 
 		 322 aa  315  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  54.29 
 
 		 322 aa  315  9e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  58.1 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  58.15 
 
 		 315 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  52.49 
 
 		 305 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  52.49 
 
 		 305 aa  311  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  54.06 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  51.48 
 
 		 321 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  49.84 
 
 		 325 aa  299  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  51.27 
 
 		 351 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  55.73 
 
 		 324 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  51.83 
 
 		 335 aa  280  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  56.91 
 
 		 312 aa  278  7e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  47.08 
 
 		 310 aa  277  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  49.03 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  51.62 
 
 		 329 aa  275  6e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  43.85 
 
 		 320 aa  275  1.0000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  50.96 
 
 		 323 aa  272  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  51.62 
 
 		 322 aa  269  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  52.84 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  46.46 
 
 		 305 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  46.6 
 
 		 336 aa  262  4.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  50 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  44.41 
 
 		 314 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  44.81 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  45.72 
 
 		 309 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  44.48 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  45.48 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  53.44 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  43.71 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  44.82 
 
 		 303 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  44.82 
 
 		 303 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  43.44 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  51.46 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  44.19 
 
 		 319 aa  245  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  45.27 
 
 		 300 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  44.33 
 
 		 308 aa  242  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  43 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  43.81 
 
 		 309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  46.78 
 
 		 326 aa  238  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  40.19 
 
 		 344 aa  235  6e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  42.43 
 
 		 316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  43.96 
 
 		 300 aa  233  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  44.15 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  43.09 
 
 		 316 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  43.92 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  51.27 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  42.21 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  44.17 
 
 		 356 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  43 
 
 		 309 aa  225  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  43.85 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  43.85 
 
 		 313 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  49.22 
 
 		 350 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  43.92 
 
 		 303 aa  216  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  41.88 
 
 		 334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  38.8 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  41.78 
 
 		 368 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  41.21 
 
 		 320 aa  206  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  38.59 
 
 		 334 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  41 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  40.27 
 
 		 292 aa  199  7.999999999999999e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  41.72 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  37.94 
 
 		 350 aa  195  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  41.02 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  39.1 
 
 		 319 aa  169  8e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  33.55 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  34.55 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  30.18 
 
 		 438 aa  142  8e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  31.54 
 
 		 293 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  45.03 
 
 		 207 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  33.21 
 
 		 298 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  31.27 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  35.27 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  28.04 
 
 		 303 aa  125  9e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  34.95 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  30.11 
 
 		 293 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  43.75 
 
 		 435 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  32.52 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  30.64 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  29.27 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  30.86 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  31.58 
 
 		 289 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  32 
 
 		 307 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>