149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_4131 on replicon NC_009360
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  100 
 
 
292 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  52.4 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  48.46 
 
 
334 aa  256  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  44.77 
 
 
319 aa  235  6e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  46.42 
 
 
311 aa  233  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  45.58 
 
 
340 aa  229  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  45.02 
 
 
320 aa  219  6e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  41.78 
 
 
314 aa  215  7e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  41.24 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  41.24 
 
 
305 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  49.08 
 
 
310 aa  211  9e-54  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  40.55 
 
 
321 aa  209  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  39.86 
 
 
318 aa  207  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  40.21 
 
 
321 aa  206  3e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  39.86 
 
 
321 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  40.07 
 
 
334 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  39.04 
 
 
319 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  38.85 
 
 
325 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  39.86 
 
 
318 aa  189  5e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  38.7 
 
 
351 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  40.27 
 
 
319 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  43.63 
 
 
315 aa  187  1e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  39.38 
 
 
299 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  39.52 
 
 
321 aa  187  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  40.08 
 
 
322 aa  186  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  40.85 
 
 
323 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  39.86 
 
 
311 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  36.52 
 
 
303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  39.32 
 
 
311 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  36.18 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  35.84 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  41.89 
 
 
319 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  35.49 
 
 
303 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  35.49 
 
 
308 aa  177  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  36.43 
 
 
303 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  40.77 
 
 
312 aa  176  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  36.52 
 
 
308 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  43.41 
 
 
266 aa  176  4e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  37.88 
 
 
309 aa  176  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  37.54 
 
 
321 aa  175  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  36.43 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  36.86 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  42.61 
 
 
326 aa  172  5e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  39.21 
 
 
310 aa  172  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  38.91 
 
 
344 aa  171  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  37.36 
 
 
325 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  38.76 
 
 
335 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  35.74 
 
 
305 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  38.11 
 
 
322 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  37.74 
 
 
322 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  37.74 
 
 
322 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  37.74 
 
 
322 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  37.74 
 
 
322 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  37.33 
 
 
300 aa  167  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  37.74 
 
 
322 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  39.49 
 
 
321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  37.74 
 
 
322 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  38.72 
 
 
309 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  36.18 
 
 
319 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  35.84 
 
 
319 aa  165  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  36.1 
 
 
333 aa  163  3e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  37.11 
 
 
301 aa  163  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  36.97 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  40.41 
 
 
336 aa  162  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  37.35 
 
 
309 aa  161  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  36.43 
 
 
313 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  37.07 
 
 
316 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  34.92 
 
 
325 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  43.4 
 
 
320 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  36.43 
 
 
313 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  36.86 
 
 
309 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  33.44 
 
 
320 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  36.82 
 
 
334 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  38.83 
 
 
328 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  38.01 
 
 
336 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  36.68 
 
 
315 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  34.75 
 
 
350 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  36.68 
 
 
315 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  34.59 
 
 
303 aa  149  6e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  37.59 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  42.11 
 
 
350 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  39.53 
 
 
329 aa  144  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  32.95 
 
 
368 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  35.14 
 
 
324 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  29.6 
 
 
435 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  29.83 
 
 
330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  29.6 
 
 
293 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  28.73 
 
 
297 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  27.35 
 
 
293 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  30.22 
 
 
297 aa  100  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  29.37 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  30.5 
 
 
335 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  30.37 
 
 
312 aa  97.4  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  27.52 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  27.52 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  27.13 
 
 
297 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  26.74 
 
 
299 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  28.03 
 
 
307 aa  94  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  31.4 
 
 
292 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  31.25 
 
 
316 aa  92.8  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>