159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_2042 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  100 
 
 
320 aa  622  1e-177  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  43.85 
 
 
319 aa  263  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  42.9 
 
 
319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  44.3 
 
 
321 aa  258  8e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  42.41 
 
 
321 aa  252  6e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  44.38 
 
 
311 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  45.05 
 
 
311 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  42.41 
 
 
321 aa  249  6e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  43.85 
 
 
322 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  43.85 
 
 
322 aa  246  4e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  43.61 
 
 
322 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  43.61 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  43.53 
 
 
322 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  43.22 
 
 
322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  42.63 
 
 
325 aa  242  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  42.9 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  44.34 
 
 
305 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  44.34 
 
 
305 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  42.5 
 
 
325 aa  235  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  42.59 
 
 
315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  43.22 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  44.06 
 
 
322 aa  230  3e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  44.79 
 
 
315 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  43.85 
 
 
315 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  38.12 
 
 
318 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  43.53 
 
 
319 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  43.4 
 
 
334 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  45.14 
 
 
312 aa  219  5e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  42.86 
 
 
305 aa  219  7e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  38.73 
 
 
316 aa  218  7.999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  44.34 
 
 
324 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  40 
 
 
323 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  40.97 
 
 
316 aa  218  1e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  39.49 
 
 
321 aa  217  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  40.82 
 
 
310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  40.06 
 
 
309 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  39.24 
 
 
329 aa  209  7e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  38.12 
 
 
318 aa  208  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  37.07 
 
 
336 aa  208  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  37.14 
 
 
351 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  36.25 
 
 
299 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  39.74 
 
 
309 aa  207  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  38.46 
 
 
335 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  38.69 
 
 
344 aa  206  4e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  38.44 
 
 
308 aa  206  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  40.13 
 
 
321 aa  205  8e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  40.59 
 
 
314 aa  204  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  39.61 
 
 
319 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  38.96 
 
 
319 aa  199  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  37.58 
 
 
303 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  36.93 
 
 
303 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  36.93 
 
 
303 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  37.07 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  38.28 
 
 
301 aa  197  3e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  37.62 
 
 
300 aa  196  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  39.68 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  38.26 
 
 
340 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  38.94 
 
 
303 aa  192  9e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  37.69 
 
 
300 aa  191  1e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  36.71 
 
 
320 aa  188  1e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  36.48 
 
 
309 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  39.11 
 
 
308 aa  187  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  40.71 
 
 
313 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 
334 aa  186  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  40.71 
 
 
313 aa  186  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  36.48 
 
 
309 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  39.62 
 
 
320 aa  185  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  37.93 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  35.32 
 
 
350 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  37.9 
 
 
328 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  52.33 
 
 
207 aa  179  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  34.2 
 
 
315 aa  177  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  35 
 
 
333 aa  175  8e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  35.41 
 
 
368 aa  175  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  35.97 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  35.92 
 
 
334 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  35.83 
 
 
309 aa  172  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  39.26 
 
 
326 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  34.52 
 
 
356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  33.44 
 
 
292 aa  155  1e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  33.01 
 
 
311 aa  152  7e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  33.82 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  32.7 
 
 
314 aa  132  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  33.13 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  28.93 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  32.05 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  27.89 
 
 
293 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  30.57 
 
 
330 aa  108  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  30.4 
 
 
303 aa  106  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  30.73 
 
 
435 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  30.77 
 
 
307 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  28.47 
 
 
289 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  30.42 
 
 
297 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  28.69 
 
 
297 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  29.66 
 
 
298 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  28.69 
 
 
297 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  30.42 
 
 
297 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  29.03 
 
 
307 aa  102  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  29.88 
 
 
296 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  27.52 
 
 
335 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>