147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1040 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  100 
 
 
319 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  96.55 
 
 
319 aa  579  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  74.59 
 
 
305 aa  462  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  71.2 
 
 
314 aa  447  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  65.36 
 
 
309 aa  401  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  71.43 
 
 
313 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  71.1 
 
 
313 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  55.19 
 
 
309 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  51.49 
 
 
303 aa  311  6.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  54 
 
 
316 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  49.83 
 
 
303 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  50 
 
 
303 aa  296  2e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  50 
 
 
300 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  50 
 
 
303 aa  295  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  48.38 
 
 
308 aa  294  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  49.68 
 
 
308 aa  292  4e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  49.36 
 
 
309 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  49.35 
 
 
309 aa  286  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  50.85 
 
 
301 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  49.68 
 
 
309 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  46.78 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  49.49 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  47.98 
 
 
326 aa  271  1e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  45.76 
 
 
321 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  45.42 
 
 
321 aa  269  4e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  45.31 
 
 
351 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  48.2 
 
 
334 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  45.13 
 
 
319 aa  250  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  43.91 
 
 
322 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  43.59 
 
 
322 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  43.59 
 
 
322 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  43.59 
 
 
322 aa  249  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  43.59 
 
 
322 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  42.95 
 
 
318 aa  248  7e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  43.59 
 
 
322 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  43.27 
 
 
322 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  42.71 
 
 
305 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  42.71 
 
 
305 aa  248  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  46.28 
 
 
303 aa  246  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  45.94 
 
 
325 aa  246  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  44.81 
 
 
319 aa  246  3e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  46.76 
 
 
322 aa  245  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  44.78 
 
 
321 aa  243  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  47.74 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  46.55 
 
 
335 aa  243  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  42.49 
 
 
325 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  46.82 
 
 
321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  47.24 
 
 
311 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  47.9 
 
 
315 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  44.01 
 
 
316 aa  237  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  43.6 
 
 
323 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  42.53 
 
 
318 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  46.67 
 
 
336 aa  229  6e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  40.26 
 
 
299 aa  228  1e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  42.57 
 
 
300 aa  224  1e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  43.83 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  43.79 
 
 
312 aa  218  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  42.76 
 
 
334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  40.13 
 
 
320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  43.42 
 
 
315 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  43.96 
 
 
315 aa  215  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  47.48 
 
 
319 aa  215  8e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  40.52 
 
 
340 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  42.44 
 
 
334 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  38.96 
 
 
320 aa  207  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  39.16 
 
 
315 aa  204  1e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  39.16 
 
 
350 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  42.77 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  43.45 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  44.37 
 
 
329 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  45.57 
 
 
320 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  37.62 
 
 
325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  45.08 
 
 
328 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  39.22 
 
 
314 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  39.59 
 
 
310 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  39.46 
 
 
356 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  37.85 
 
 
368 aa  192  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  39.22 
 
 
311 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  49.28 
 
 
350 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  41.86 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  35.84 
 
 
292 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  37.74 
 
 
266 aa  159  6e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  32.27 
 
 
330 aa  159  7e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  36.25 
 
 
319 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  32.63 
 
 
333 aa  157  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  30.9 
 
 
438 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  35.83 
 
 
207 aa  116  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  31.23 
 
 
298 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  29.79 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  29.79 
 
 
297 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  29.52 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  29.08 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  32.97 
 
 
299 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  29.43 
 
 
297 aa  106  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  28.78 
 
 
297 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  28.1 
 
 
297 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  27.27 
 
 
289 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  29.77 
 
 
294 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  30.8 
 
 
312 aa  99.4  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  27.27 
 
 
297 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.934917 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>