143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0066 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 309 aa  585  1e-166  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  65.36 
 
 		 319 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  65.67 
 
 		 319 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  60.33 
 
 		 305 aa  371  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  57.79 
 
 		 314 aa  362  6e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  58.25 
 
 		 313 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  57.93 
 
 		 313 aa  319  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  48.37 
 
 		 316 aa  271  7e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  48.15 
 
 		 303 aa  269  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  45.48 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  45.15 
 
 		 303 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  45.48 
 
 		 303 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  46.05 
 
 		 309 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  45.73 
 
 		 300 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  48.18 
 
 		 351 aa  265  8.999999999999999e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  48.69 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  45.39 
 
 		 308 aa  261  8e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  47.46 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  44.97 
 
 		 308 aa  260  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  43.97 
 
 		 309 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  44.74 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  44.26 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  49.64 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  44.3 
 
 		 309 aa  245  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  44.16 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  45.51 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  43.22 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  48.28 
 
 		 335 aa  235  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  43.87 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  43.38 
 
 		 319 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  46.98 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  46.3 
 
 		 325 aa  232  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  43.71 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  41.81 
 
 		 322 aa  228  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  43.8 
 
 		 321 aa  228  8e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  42.91 
 
 		 303 aa  227  2e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  46.67 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  47 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  41.14 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  41.14 
 
 		 322 aa  224  1e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  41.14 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  40.8 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  39.93 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  38.64 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  38.64 
 
 		 305 aa  219  3.9999999999999997e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  40.07 
 
 		 318 aa  219  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  40.13 
 
 		 322 aa  218  7e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  47.59 
 
 		 336 aa  218  8.999999999999998e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  40.13 
 
 		 325 aa  215  8e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  43.61 
 
 		 340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  40.06 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  41.64 
 
 		 320 aa  212  7e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  43.62 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  43.05 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  42.52 
 
 		 316 aa  210  3e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  40.61 
 
 		 368 aa  209  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  40.73 
 
 		 300 aa  209  5e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  46.02 
 
 		 321 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  43.39 
 
 		 312 aa  207  3e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  39.14 
 
 		 318 aa  205  6e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  43.48 
 
 		 315 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  37.83 
 
 		 299 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  42.02 
 
 		 334 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  38.62 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  46.13 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  42.76 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  37 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  42.66 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  46.84 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  42.09 
 
 		 315 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  45.49 
 
 		 324 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  43 
 
 		 329 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  40.54 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  38.36 
 
 		 314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  47.97 
 
 		 350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  37.62 
 
 		 325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  45.48 
 
 		 320 aa  182  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  44.67 
 
 		 310 aa  178  9e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  37.99 
 
 		 356 aa  176  6e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  40.79 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  38.72 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  34.64 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  37.5 
 
 		 266 aa  153  4e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  31.41 
 
 		 330 aa  150  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  36.59 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  29.59 
 
 		 438 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  31.01 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  31.01 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  30.66 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  30.94 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  29.87 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  30.88 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  30.15 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  32.29 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  30.8 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  35.26 
 
 		 207 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  31.62 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  30 
 
 		 284 aa  94.7  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  32.72 
 
 		 312 aa  93.2  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  32.62 
 
 		 435 aa  93.2  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>