163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3729 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 309 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  98.38 
 
 		 309 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  96.76 
 
 		 309 aa  570  1e-161  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  89.64 
 
 		 308 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  82.45 
 
 		 303 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  82.45 
 
 		 303 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  82.12 
 
 		 303 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  83.84 
 
 		 300 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  80.26 
 
 		 308 aa  500  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  56.85 
 
 		 309 aa  317  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  51.47 
 
 		 344 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  50.99 
 
 		 303 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  51.36 
 
 		 316 aa  295  6e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  52.36 
 
 		 301 aa  290  3e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  49.68 
 
 		 319 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  49.67 
 
 		 319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  45.07 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  47.8 
 
 		 303 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  45.45 
 
 		 314 aa  271  9e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  44.3 
 
 		 309 aa  262  4.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  47.04 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  49.02 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  44.15 
 
 		 321 aa  248  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  46.71 
 
 		 313 aa  248  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  43.48 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  43.14 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  43.04 
 
 		 325 aa  241  9e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  43 
 
 		 319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  43.67 
 
 		 321 aa  235  7e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  41.95 
 
 		 318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  43 
 
 		 319 aa  232  5e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  43.14 
 
 		 315 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  43.67 
 
 		 300 aa  228  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  42.9 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  42.27 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  41.83 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  43.1 
 
 		 351 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  39.87 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  41.89 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  41.06 
 
 		 322 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  41.39 
 
 		 322 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  41.39 
 
 		 322 aa  215  8e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  40 
 
 		 311 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  41.06 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  41.06 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  40.26 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  40.73 
 
 		 322 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  44.16 
 
 		 319 aa  212  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  41.16 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  41.16 
 
 		 305 aa  212  5.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  41.97 
 
 		 325 aa  212  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  40.73 
 
 		 322 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  42.47 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  43.57 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  39.87 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  41.69 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  41.22 
 
 		 312 aa  203  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  41.45 
 
 		 336 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  40.07 
 
 		 321 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  40.53 
 
 		 315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  39.93 
 
 		 310 aa  195  6e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  40.27 
 
 		 336 aa  192  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  37.71 
 
 		 334 aa  189  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  41.64 
 
 		 329 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  35.5 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  35.83 
 
 		 320 aa  189  5.999999999999999e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  39.13 
 
 		 350 aa  188  8e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  38.36 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  43.79 
 
 		 328 aa  186  6e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  40.29 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  39.03 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  38.72 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  44.26 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  39.23 
 
 		 324 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  38.72 
 
 		 315 aa  180  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  36.92 
 
 		 368 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  36.86 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  44.56 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  40.28 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  36.68 
 
 		 333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  36.52 
 
 		 356 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  36.03 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  35.02 
 
 		 266 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  34.42 
 
 		 319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  31.85 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  32.19 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  31.85 
 
 		 297 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  34.01 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  35.91 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  30.58 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  31.99 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  29.23 
 
 		 312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  30.94 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  28.21 
 
 		 316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  32.49 
 
 		 297 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  30.26 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  30.51 
 
 		 435 aa  109  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  30.58 
 
 		 303 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  31.68 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  32.56 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>