189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3652 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  100 
 
 
309 aa  606  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  56.8 
 
 
303 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  57.14 
 
 
303 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  56.8 
 
 
300 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  54.25 
 
 
308 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  56.12 
 
 
303 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  57.91 
 
 
316 aa  329  3e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  55.78 
 
 
308 aa  328  7e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  56.85 
 
 
309 aa  324  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  56.31 
 
 
309 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  55.19 
 
 
319 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  54.27 
 
 
303 aa  318  5e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  54.58 
 
 
305 aa  318  9e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  52.27 
 
 
314 aa  316  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  57.24 
 
 
319 aa  315  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  56.85 
 
 
309 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  55.63 
 
 
344 aa  308  6.999999999999999e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  55.97 
 
 
301 aa  308  9e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  51.3 
 
 
313 aa  282  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  52.2 
 
 
303 aa  281  9e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  50.97 
 
 
313 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  46.05 
 
 
309 aa  275  5e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  47.02 
 
 
321 aa  259  3e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  48.84 
 
 
325 aa  255  6e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  47.62 
 
 
321 aa  255  8e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  50.17 
 
 
326 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  46.03 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  45.92 
 
 
321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  45.07 
 
 
334 aa  251  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  45.72 
 
 
319 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  47.84 
 
 
322 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  45.55 
 
 
305 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  45.55 
 
 
305 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  44.48 
 
 
351 aa  245  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  44.08 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  43.75 
 
 
322 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  43.75 
 
 
322 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  43.75 
 
 
322 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  43.28 
 
 
322 aa  240  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  43.75 
 
 
322 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  41.83 
 
 
318 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  45.7 
 
 
311 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  43.42 
 
 
322 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  43.75 
 
 
325 aa  237  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  43.25 
 
 
323 aa  237  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  46.05 
 
 
315 aa  235  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  45.7 
 
 
311 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  45.07 
 
 
300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  44.48 
 
 
321 aa  228  9e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  49.62 
 
 
319 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  43.56 
 
 
318 aa  222  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  43.45 
 
 
316 aa  222  7e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  43.58 
 
 
335 aa  221  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  46.21 
 
 
312 aa  218  8.999999999999998e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  41.25 
 
 
299 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  42.55 
 
 
334 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  39.74 
 
 
320 aa  216  5e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  45.05 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  43.73 
 
 
336 aa  212  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  42.96 
 
 
310 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  43.2 
 
 
336 aa  211  1e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  41.99 
 
 
320 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  42.42 
 
 
329 aa  207  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  45.02 
 
 
321 aa  208  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  43.19 
 
 
315 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  48.35 
 
 
328 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  42.81 
 
 
315 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  40.48 
 
 
350 aa  202  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  38.87 
 
 
368 aa  195  8.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  38.28 
 
 
315 aa  194  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  40.54 
 
 
311 aa  193  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  48.75 
 
 
350 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  39.39 
 
 
334 aa  192  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  36.88 
 
 
325 aa  191  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  38.13 
 
 
340 aa  188  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  37.2 
 
 
356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  42.38 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  44.48 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  40.52 
 
 
324 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  37.35 
 
 
292 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  34.43 
 
 
333 aa  171  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  35.69 
 
 
314 aa  167  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  37.05 
 
 
319 aa  161  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  30.12 
 
 
435 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  33.46 
 
 
266 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  34.36 
 
 
297 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  34.36 
 
 
297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  34.36 
 
 
297 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  32.86 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  32.71 
 
 
294 aa  125  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  34.41 
 
 
299 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  29.81 
 
 
330 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  33.85 
 
 
303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  39.23 
 
 
207 aa  120  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  34.33 
 
 
297 aa  119  6e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  32.16 
 
 
307 aa  119  6e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  30.87 
 
 
298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  33.33 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  33.19 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  31.64 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>