156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1227 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  100 
 
 
318 aa  619  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  92.77 
 
 
318 aa  555  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  87.11 
 
 
299 aa  543  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  62.38 
 
 
311 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  61.27 
 
 
315 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  63.09 
 
 
319 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  62.06 
 
 
311 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  62.03 
 
 
319 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  60.06 
 
 
315 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  61.46 
 
 
321 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  59.43 
 
 
315 aa  333  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  60.19 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  53.25 
 
 
325 aa  309  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  50 
 
 
321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  56.38 
 
 
322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  49.03 
 
 
321 aa  302  5.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  49.84 
 
 
322 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  49.84 
 
 
322 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  50.8 
 
 
325 aa  300  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  50.16 
 
 
322 aa  300  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  48.39 
 
 
321 aa  299  4e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  50.16 
 
 
322 aa  298  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  49.84 
 
 
322 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  49.84 
 
 
322 aa  296  4e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  50.5 
 
 
305 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  50.5 
 
 
305 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  49.84 
 
 
322 aa  295  9e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  51.17 
 
 
334 aa  286  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  50.65 
 
 
323 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  50.17 
 
 
351 aa  282  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  47.4 
 
 
321 aa  279  5e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  43.18 
 
 
314 aa  266  4e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  50.64 
 
 
312 aa  265  8e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  49.16 
 
 
335 aa  263  3e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  44.66 
 
 
310 aa  257  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  52.2 
 
 
320 aa  252  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  42.72 
 
 
305 aa  252  6e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  50.91 
 
 
319 aa  251  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  45.97 
 
 
321 aa  251  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  49.83 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  51.55 
 
 
328 aa  245  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  43.61 
 
 
313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  43.61 
 
 
313 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  41.81 
 
 
303 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  41.47 
 
 
303 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  41.47 
 
 
303 aa  240  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  42.96 
 
 
344 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  42.37 
 
 
300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  42.95 
 
 
319 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  41.72 
 
 
308 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  45.54 
 
 
329 aa  235  7e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  41.97 
 
 
319 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  39.6 
 
 
308 aa  233  3e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  41.45 
 
 
309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  43.05 
 
 
303 aa  233  5e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  42.62 
 
 
326 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  41.14 
 
 
316 aa  232  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  42.86 
 
 
336 aa  232  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  44.98 
 
 
301 aa  229  4e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  41.06 
 
 
309 aa  228  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  41.47 
 
 
300 aa  228  8e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  41.83 
 
 
309 aa  226  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  41.47 
 
 
316 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  38.12 
 
 
320 aa  224  2e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  41.67 
 
 
315 aa  223  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  41.02 
 
 
303 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  40.07 
 
 
309 aa  219  6e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  42.04 
 
 
325 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  41.95 
 
 
309 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  48.03 
 
 
350 aa  216  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  41.72 
 
 
356 aa  215  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  42.14 
 
 
334 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  40.2 
 
 
311 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  43.24 
 
 
340 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  39.86 
 
 
292 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  35.49 
 
 
333 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  38.83 
 
 
320 aa  200  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  41.2 
 
 
310 aa  194  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  38.57 
 
 
368 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  36.69 
 
 
334 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  37.37 
 
 
350 aa  181  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  36.79 
 
 
319 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  35.07 
 
 
314 aa  157  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  32.27 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  38.07 
 
 
435 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  32.04 
 
 
307 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  31.32 
 
 
312 aa  130  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  34.13 
 
 
299 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  32.63 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  36.57 
 
 
266 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  30.86 
 
 
298 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  36.26 
 
 
438 aa  123  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  33.45 
 
 
316 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  42.26 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  28.57 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  31.52 
 
 
289 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  31.32 
 
 
307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  32.08 
 
 
335 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2141  bile acid:sodium symporter  32.13 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.219683  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  31.49 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>