138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2456 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 368 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  66.28 
 
 		 350 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  60.26 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  37.69 
 
 		 435 aa  237  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  38.71 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  38.71 
 
 		 305 aa  231  2e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  39.72 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  44.44 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  40.61 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  40.85 
 
 		 319 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  38.64 
 
 		 305 aa  209  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  41.78 
 
 		 319 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  39.67 
 
 		 351 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  38.33 
 
 		 314 aa  205  1e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  39.51 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  37.87 
 
 		 321 aa  199  7.999999999999999e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  40.36 
 
 		 322 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  38.57 
 
 		 318 aa  193  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  37.09 
 
 		 344 aa  192  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  38.81 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  38.87 
 
 		 321 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  40.52 
 
 		 321 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  37.85 
 
 		 319 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  38.21 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  38.03 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  39.14 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  37.23 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  38.87 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  38.13 
 
 		 321 aa  186  8e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  39.53 
 
 		 312 aa  186  8e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  36.54 
 
 		 340 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  37.41 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  38.94 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  38.41 
 
 		 318 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  37.78 
 
 		 303 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  39.1 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  37.28 
 
 		 309 aa  182  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  37.68 
 
 		 299 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  37 
 
 		 300 aa  182  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  36.27 
 
 		 308 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  37.13 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  37.82 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  37.36 
 
 		 321 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  33.54 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  37.28 
 
 		 309 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  36.67 
 
 		 303 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  35.23 
 
 		 300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  37.16 
 
 		 311 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  36.83 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  34.75 
 
 		 320 aa  179  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  37.84 
 
 		 311 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  39.39 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  38.56 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  38.56 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  35.99 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  37.5 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  38.24 
 
 		 322 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  37.63 
 
 		 303 aa  176  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  51.38 
 
 		 438 aa  176  7e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  36.24 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  38.56 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  36.66 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  36.04 
 
 		 315 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  37.85 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  35.59 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  35.71 
 
 		 315 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  36.92 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  36.88 
 
 		 301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  34.92 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  40.77 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  34.27 
 
 		 324 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  33.12 
 
 		 329 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  36.08 
 
 		 310 aa  159  7e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  35.48 
 
 		 303 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  33.44 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  34.57 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  34.97 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  37.59 
 
 		 328 aa  144  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  33.98 
 
 		 292 aa  144  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  32.99 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  38.72 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  35.15 
 
 		 319 aa  137  4e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  29.61 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  36.84 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  29.62 
 
 		 307 aa  123  7e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  28.73 
 
 		 299 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  32.36 
 
 		 303 aa  120  3e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  29.29 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  30.36 
 
 		 288 aa  117  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  29.41 
 
 		 293 aa  116  5e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  28.93 
 
 		 297 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  30.04 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  28.37 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  28.21 
 
 		 294 aa  113  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  32.42 
 
 		 307 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  31.17 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  31.95 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  30.94 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  29.43 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  28.62 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>