191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0921 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 
316 aa  621  1e-177  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  49.15 
 
 
300 aa  275  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  46.82 
 
 
321 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  46.15 
 
 
321 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  45.48 
 
 
321 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  50 
 
 
315 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  41.8 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  43.56 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  43.56 
 
 
305 aa  233  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  42.95 
 
 
321 aa  232  5e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  48.21 
 
 
335 aa  230  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  44.22 
 
 
305 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  45.24 
 
 
319 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  44.01 
 
 
319 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  43.2 
 
 
314 aa  225  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  41.47 
 
 
318 aa  226  6e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  42.26 
 
 
344 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  45.7 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  44.85 
 
 
321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  40.51 
 
 
319 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  45.45 
 
 
326 aa  220  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  43.09 
 
 
319 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  40.97 
 
 
320 aa  218  1e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  45.36 
 
 
311 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  47.22 
 
 
336 aa  216  4e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  46.94 
 
 
336 aa  215  9e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  42.57 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  42.09 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  41.75 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  42.03 
 
 
300 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  42.86 
 
 
303 aa  210  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  41.41 
 
 
303 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  42.52 
 
 
309 aa  210  3e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  46.38 
 
 
322 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  44.77 
 
 
329 aa  209  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  41.39 
 
 
318 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  42.05 
 
 
322 aa  205  8e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  42.05 
 
 
322 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  38.82 
 
 
308 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  41.7 
 
 
322 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  44.56 
 
 
313 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  41.7 
 
 
322 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  42.09 
 
 
316 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  39.4 
 
 
299 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  41.7 
 
 
322 aa  203  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  44.56 
 
 
313 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  44.48 
 
 
301 aa  203  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  41.4 
 
 
322 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  41.7 
 
 
322 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  39.4 
 
 
310 aa  202  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  42.86 
 
 
340 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  41.16 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  41.91 
 
 
308 aa  199  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  43.71 
 
 
351 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  44.64 
 
 
311 aa  199  5e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  43.57 
 
 
309 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  44.66 
 
 
334 aa  198  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  41.8 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  42.01 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  39.67 
 
 
312 aa  195  9e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  42.57 
 
 
315 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  43.01 
 
 
315 aa  195  1e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  39.77 
 
 
334 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  41.59 
 
 
315 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  46.18 
 
 
319 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  44.74 
 
 
320 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  37.75 
 
 
325 aa  189  7e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  43.57 
 
 
309 aa  187  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  38.87 
 
 
350 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  41.55 
 
 
334 aa  185  7e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  42.35 
 
 
356 aa  185  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  45.52 
 
 
310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  41.9 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  43.23 
 
 
324 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  39.07 
 
 
323 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  44.55 
 
 
328 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  37.13 
 
 
368 aa  176  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  45.7 
 
 
350 aa  170  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  32.9 
 
 
333 aa  169  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  36.97 
 
 
292 aa  162  6e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  37.46 
 
 
319 aa  155  7e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  43.97 
 
 
320 aa  152  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  28.53 
 
 
435 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  32.75 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  31.13 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  31.13 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  31.13 
 
 
297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  30.15 
 
 
289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  30.15 
 
 
316 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  32.71 
 
 
307 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  29.29 
 
 
299 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  25.99 
 
 
297 aa  102  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  27.86 
 
 
298 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  28.52 
 
 
303 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  39.1 
 
 
438 aa  99.4  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  29.2 
 
 
307 aa  99  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0306  Bile acid:sodium symporter  29.63 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  32.68 
 
 
266 aa  97.4  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  31.96 
 
 
297 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  28.46 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>