133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0306 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0306  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 295 aa  568  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  60.41 
 
 		 293 aa  340  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  62.81 
 
 		 292 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  58.76 
 
 		 296 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  58.22 
 
 		 296 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  55.02 
 
 		 297 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  53.31 
 
 		 297 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  53.31 
 
 		 297 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  55.71 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  52.96 
 
 		 297 aa  280  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  51.54 
 
 		 299 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  53.1 
 
 		 297 aa  255  5e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  45.92 
 
 		 291 aa  225  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  40.61 
 
 		 335 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  37.06 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  41.33 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  39.13 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  32.1 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  33.7 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  32.75 
 
 		 307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  35.48 
 
 		 297 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  36.94 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  38.32 
 
 		 315 aa  138  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  35.77 
 
 		 297 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  34.85 
 
 		 285 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  28.67 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  28.67 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  32.22 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  29.43 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  31.03 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  28.42 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  32.75 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  35 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  31.8 
 
 		 335 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  28.06 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  30.04 
 
 		 316 aa  100  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  27.45 
 
 		 314 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  27.27 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  27.46 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  26.09 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02093  P3 protein  33.82 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000002356  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  26.13 
 
 		 368 aa  95.5  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  32.27 
 
 		 311 aa  95.1  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  27.91 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  31.4 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  29.17 
 
 		 325 aa  92  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  29.69 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  30.21 
 
 		 340 aa  91.3  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  28.42 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  25.62 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  30.83 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  29.24 
 
 		 316 aa  89.7  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  30.12 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  30.12 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  25.45 
 
 		 321 aa  87.4  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  25.19 
 
 		 350 aa  87  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  25.87 
 
 		 318 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  27.62 
 
 		 300 aa  87  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  28.27 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  29.73 
 
 		 300 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  29.34 
 
 		 303 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  29.59 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  32.37 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  28.14 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  28.14 
 
 		 319 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  27.76 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  30.12 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  30.71 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  31.01 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  30.57 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  30.86 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  28.63 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2141  bile acid:sodium symporter  32.92 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.219683  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  27.46 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  28.45 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  30.17 
 
 		 320 aa  82.8  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  26.85 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  25.61 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  26.67 
 
 		 312 aa  80.9  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  28.62 
 
 		 336 aa  80.5  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  30.04 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  30.53 
 
 		 326 aa  79.3  0.00000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  32.05 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  26.72 
 
 		 311 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  28.96 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  32.05 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  27.1 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  28.47 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  27.3 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  28.96 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  29.48 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  28.09 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  27.92 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  26.46 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  25.88 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  27.23 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  38.96 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  27.66 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  27.23 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  28.45 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>