132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2868 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 293 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  71.28 
 
 		 292 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  64.73 
 
 		 296 aa  339  4e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  65.72 
 
 		 296 aa  335  3.9999999999999995e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0306  Bile acid:sodium symporter  60.41 
 
 		 295 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  58.74 
 
 		 297 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  56.94 
 
 		 299 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  58.39 
 
 		 297 aa  316  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  58.74 
 
 		 297 aa  316  4e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  59.3 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  59.57 
 
 		 297 aa  309  4e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  60.57 
 
 		 297 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  52.94 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  44.98 
 
 		 335 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  43.54 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  39.01 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  37.72 
 
 		 289 aa  178  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  36.3 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  41 
 
 		 294 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  38.81 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  38.08 
 
 		 307 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  38.1 
 
 		 297 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  38.33 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  32.97 
 
 		 297 aa  152  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  33.7 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02093  P3 protein  37.02 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000002356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  31.68 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  31.68 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  33.22 
 
 		 335 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  29.78 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  32.03 
 
 		 325 aa  115  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  31.05 
 
 		 344 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  31.21 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  30.82 
 
 		 316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  32.49 
 
 		 340 aa  110  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  35.25 
 
 		 310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  32.53 
 
 		 334 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  31.47 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  32.37 
 
 		 321 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  32.43 
 
 		 305 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  29.62 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  30.72 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  33.85 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  28.91 
 
 		 318 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  32.26 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  31.56 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  32.3 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  31.87 
 
 		 321 aa  99.4  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  30.13 
 
 		 321 aa  99  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  30.93 
 
 		 320 aa  98.2  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  29.25 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  26.39 
 
 		 334 aa  96.3  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  33.07 
 
 		 319 aa  95.9  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  28.97 
 
 		 325 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  31.51 
 
 		 309 aa  94.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  31.16 
 
 		 311 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  27.24 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  30.2 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  31.51 
 
 		 309 aa  93.2  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  30.48 
 
 		 311 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  29.91 
 
 		 319 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  32.82 
 
 		 329 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  31.49 
 
 		 313 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  29.55 
 
 		 316 aa  91.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  32.78 
 
 		 334 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  29.49 
 
 		 319 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  31.49 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  31.4 
 
 		 315 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  28.24 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  28.11 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  26.64 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  29.46 
 
 		 303 aa  89.7  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  27.24 
 
 		 293 aa  89.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2141  bile acid:sodium symporter  33.86 
 
 		 310 aa  89  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.219683  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  30.5 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  28.81 
 
 		 303 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  26.76 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  29.29 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  30.86 
 
 		 356 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  28.25 
 
 		 318 aa  86.3  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  28.69 
 
 		 292 aa  85.9  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  27.87 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  31.82 
 
 		 336 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  29.54 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  29.5 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  27.91 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  29.35 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  28.67 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  31.28 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  28.51 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  38.65 
 
 		 328 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  30.71 
 
 		 309 aa  82  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  30.29 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  27.16 
 
 		 321 aa  80.5  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  24.39 
 
 		 319 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  24.28 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  27.16 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  29.3 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  29.75 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  24.58 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>