130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0178 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 
315 aa  586  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  35.61 
 
 
284 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  35.18 
 
 
297 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  34.49 
 
 
289 aa  154  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  35 
 
 
335 aa  152  8.999999999999999e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  40.14 
 
 
307 aa  151  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  35.69 
 
 
292 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  40.08 
 
 
294 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  38.33 
 
 
293 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  34.4 
 
 
298 aa  144  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  35.82 
 
 
297 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  33.57 
 
 
307 aa  142  5e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  36.43 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  32.47 
 
 
303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  36.43 
 
 
297 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  36.08 
 
 
299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  36.4 
 
 
297 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  34.48 
 
 
297 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  34.78 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  35.48 
 
 
296 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  32.27 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  36.3 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0306  Bile acid:sodium symporter  38.32 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  31.88 
 
 
291 aa  125  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02093  P3 protein  36.24 
 
 
221 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000002356  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  38.29 
 
 
297 aa  124  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  29.86 
 
 
288 aa  123  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  31.82 
 
 
297 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  31.85 
 
 
305 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  31.85 
 
 
305 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  33.09 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  32.23 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  31.53 
 
 
325 aa  107  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  32.26 
 
 
334 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  33.1 
 
 
319 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  33.06 
 
 
340 aa  103  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  28.86 
 
 
344 aa  103  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  31.18 
 
 
309 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  29.74 
 
 
321 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  26.48 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  28.46 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  30.68 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  28.2 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  34.41 
 
 
336 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  28.03 
 
 
321 aa  94.4  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  28.42 
 
 
303 aa  93.6  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  29.79 
 
 
318 aa  92.4  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  30.04 
 
 
315 aa  92.4  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  32.54 
 
 
311 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  31.98 
 
 
310 aa  92  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  28.42 
 
 
303 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  28.42 
 
 
303 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  31.67 
 
 
335 aa  92  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  32.38 
 
 
323 aa  92  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  32.23 
 
 
303 aa  91.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  33.87 
 
 
316 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  27.24 
 
 
308 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  27.05 
 
 
310 aa  90.9  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  29.55 
 
 
292 aa  90.5  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  28.52 
 
 
300 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  28.47 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  33.47 
 
 
299 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  28.57 
 
 
351 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  30.38 
 
 
315 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  28.33 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  25.61 
 
 
334 aa  86.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  30.21 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  26.2 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  30.22 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  29.58 
 
 
318 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  29.12 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  28.88 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  29.17 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  26.14 
 
 
325 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  25.2 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  33.46 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  28.89 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  30.99 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  28.03 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  30.89 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  27.87 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  25.77 
 
 
319 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  26.44 
 
 
319 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  30.58 
 
 
309 aa  82.4  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  30.36 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  31.45 
 
 
326 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  28.72 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  26.47 
 
 
305 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  26.97 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  27.62 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  28.52 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0839  sodium/bile acid symporter family protein  27.82 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00253549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  27.2 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  27.2 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  27.2 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  27.2 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  27.2 
 
 
322 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  28.46 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  31.42 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>