132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2779 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  100 
 
 
296 aa  566  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  88.18 
 
 
296 aa  471  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  63.64 
 
 
292 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  65.72 
 
 
293 aa  330  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0306  Bile acid:sodium symporter  58.22 
 
 
295 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  60.99 
 
 
297 aa  311  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  59.79 
 
 
297 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  55.59 
 
 
299 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  59.93 
 
 
297 aa  292  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  55.44 
 
 
297 aa  291  7e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  55.79 
 
 
297 aa  291  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  55.79 
 
 
297 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  53.82 
 
 
291 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  46.31 
 
 
307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  41.72 
 
 
335 aa  210  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  40 
 
 
289 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  37.98 
 
 
307 aa  181  2e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  38.89 
 
 
297 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  35.48 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  42.08 
 
 
294 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  36.84 
 
 
298 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  34.41 
 
 
297 aa  160  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  34.2 
 
 
297 aa  151  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  35.69 
 
 
284 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  36.3 
 
 
315 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  32.7 
 
 
305 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  32.7 
 
 
305 aa  130  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02093  P3 protein  38.46 
 
 
221 aa  128  9.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000002356  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  37.81 
 
 
336 aa  122  9e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  35.77 
 
 
299 aa  119  7.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  32.17 
 
 
285 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  34.71 
 
 
319 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  30.83 
 
 
334 aa  113  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  32.95 
 
 
321 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  34.57 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  35.34 
 
 
322 aa  112  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  31.94 
 
 
316 aa  112  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  32.52 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  30.18 
 
 
325 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  32.57 
 
 
321 aa  109  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  31.8 
 
 
340 aa  109  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  31.93 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2141  bile acid:sodium symporter  35.57 
 
 
310 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.219683  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  31.78 
 
 
321 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  29.45 
 
 
344 aa  107  3e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  33.58 
 
 
310 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  35.8 
 
 
329 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  29.21 
 
 
288 aa  106  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  30.8 
 
 
318 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  33.8 
 
 
335 aa  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  31.66 
 
 
321 aa  104  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  32.64 
 
 
320 aa  103  4e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  30.04 
 
 
293 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  30.33 
 
 
320 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  29.8 
 
 
310 aa  102  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  29.6 
 
 
316 aa  101  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  33.07 
 
 
319 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  28.94 
 
 
303 aa  100  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  28.21 
 
 
305 aa  100  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  31.01 
 
 
299 aa  99.8  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  31.65 
 
 
311 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  28.21 
 
 
314 aa  99  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  28.12 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  30.62 
 
 
311 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  32.5 
 
 
334 aa  97.1  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  31.62 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  29.46 
 
 
301 aa  95.9  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  31.4 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  31.17 
 
 
351 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  31.4 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  33.61 
 
 
309 aa  94  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  34.02 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  29.28 
 
 
308 aa  92.8  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  28.87 
 
 
325 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  31.3 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  29.66 
 
 
303 aa  92  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  30.89 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  28.78 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  30.33 
 
 
300 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  29.07 
 
 
303 aa  89.7  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  33.33 
 
 
336 aa  89  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  29.07 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  28.51 
 
 
350 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  29.07 
 
 
321 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  29.11 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  29.11 
 
 
319 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  28.68 
 
 
300 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  28.68 
 
 
303 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  29.73 
 
 
319 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  30.13 
 
 
312 aa  86.3  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  29.55 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  29.96 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  24.57 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  28.74 
 
 
319 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  27.48 
 
 
292 aa  83.6  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  28.81 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  26.27 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  25.85 
 
 
322 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  25.85 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  25.85 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>