151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1540 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  100 
 
 
321 aa  625  1e-178  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  70.4 
 
 
321 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  69.78 
 
 
321 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  71.7 
 
 
321 aa  450  1e-125  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  51.78 
 
 
319 aa  308  5.9999999999999995e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  51.48 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  45.05 
 
 
325 aa  294  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  47.4 
 
 
318 aa  291  1e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  47.91 
 
 
322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  47.9 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  48.22 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  47.9 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  47.59 
 
 
322 aa  282  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  46.18 
 
 
305 aa  282  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  46.18 
 
 
305 aa  282  7.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  47.9 
 
 
322 aa  281  9e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  47.28 
 
 
311 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  46.93 
 
 
322 aa  277  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  49.01 
 
 
323 aa  276  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  47.4 
 
 
318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  46.65 
 
 
311 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  46.91 
 
 
315 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  47.1 
 
 
325 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  45.95 
 
 
299 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  48.87 
 
 
312 aa  269  4e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  49.47 
 
 
322 aa  269  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  44.93 
 
 
300 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  49.83 
 
 
310 aa  266  4e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  45.57 
 
 
334 aa  261  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  45.57 
 
 
351 aa  261  1e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  44.41 
 
 
335 aa  259  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  44.93 
 
 
344 aa  259  6e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  45.37 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  44.12 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  47.66 
 
 
336 aa  252  6e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  44.78 
 
 
319 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  44.93 
 
 
319 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  45.73 
 
 
321 aa  247  2e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  45.66 
 
 
325 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  49.02 
 
 
326 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  43.29 
 
 
314 aa  245  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  51.3 
 
 
328 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  43.8 
 
 
309 aa  243  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  45.21 
 
 
316 aa  241  9e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  47.01 
 
 
319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  45.16 
 
 
321 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  44.11 
 
 
316 aa  238  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  45.54 
 
 
315 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  46.38 
 
 
329 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  41.95 
 
 
303 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  42.33 
 
 
308 aa  236  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  44.41 
 
 
303 aa  236  3e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  45.16 
 
 
315 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  41.95 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  41.61 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  42.37 
 
 
300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  44 
 
 
309 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  43.67 
 
 
309 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  44.64 
 
 
309 aa  230  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  39.49 
 
 
320 aa  229  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  43.77 
 
 
313 aa  228  9e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  43.77 
 
 
313 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  42.81 
 
 
308 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  42.37 
 
 
356 aa  225  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  44.95 
 
 
324 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  43.67 
 
 
309 aa  222  8e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  40.54 
 
 
301 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  40.86 
 
 
315 aa  220  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  44.11 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  46.3 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  45.82 
 
 
350 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  38.69 
 
 
350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  38.87 
 
 
334 aa  200  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  39.63 
 
 
334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  39.52 
 
 
292 aa  198  9e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  42.28 
 
 
340 aa  196  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  40.44 
 
 
320 aa  194  1e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  33.44 
 
 
333 aa  192  4e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  37.13 
 
 
311 aa  191  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  37.36 
 
 
368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  41.45 
 
 
310 aa  182  6e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  35.24 
 
 
319 aa  167  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  29.61 
 
 
435 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  27.01 
 
 
438 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  31.77 
 
 
314 aa  146  5e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  30.46 
 
 
330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  33.85 
 
 
266 aa  135  7.000000000000001e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  33.94 
 
 
289 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  33.1 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  31.25 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  30.15 
 
 
294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  41.18 
 
 
207 aa  122  6e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  32.18 
 
 
297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2141  bile acid:sodium symporter  32.26 
 
 
310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.219683  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  32.18 
 
 
297 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  31.03 
 
 
335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  32.18 
 
 
297 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  31.69 
 
 
307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  29.43 
 
 
297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  31.21 
 
 
297 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>