93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0856 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  100 
 
 		 207 aa  420  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  52.33 
 
 		 320 aa  179  2e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  42.01 
 
 		 321 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  42.25 
 
 		 325 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  40.35 
 
 		 321 aa  124  7e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  39.88 
 
 		 321 aa  122  4e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  42.69 
 
 		 318 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  36.46 
 
 		 309 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  45.03 
 
 		 319 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  44.83 
 
 		 319 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  45.56 
 
 		 311 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  35.91 
 
 		 309 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  36.78 
 
 		 344 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  45.88 
 
 		 311 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  41.04 
 
 		 299 aa  115  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  40.96 
 
 		 305 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  40.96 
 
 		 305 aa  114  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  34.81 
 
 		 308 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  35.36 
 
 		 308 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  43.6 
 
 		 321 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  43.93 
 
 		 318 aa  111  8.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  36.31 
 
 		 303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  36.31 
 
 		 303 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  38.69 
 
 		 316 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  35.83 
 
 		 319 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  36.31 
 
 		 303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  41.86 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  42.11 
 
 		 315 aa  109  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  35.8 
 
 		 300 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  39.23 
 
 		 309 aa  108  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  39.64 
 
 		 322 aa  108  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  40.23 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  41.57 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  41.18 
 
 		 321 aa  106  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  35.83 
 
 		 319 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  36.84 
 
 		 334 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  42.86 
 
 		 324 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  35.33 
 
 		 336 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  39.08 
 
 		 319 aa  102  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  38.04 
 
 		 351 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  35.67 
 
 		 309 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  35.91 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  37.13 
 
 		 303 aa  98.6  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  34.68 
 
 		 314 aa  98.2  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  35.88 
 
 		 335 aa  97.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  34.68 
 
 		 300 aa  96.7  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  36.22 
 
 		 322 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  36.76 
 
 		 322 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  39.52 
 
 		 310 aa  95.9  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  36.76 
 
 		 322 aa  95.5  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  36.76 
 
 		 322 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  36.76 
 
 		 322 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  36.76 
 
 		 322 aa  94  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  36.76 
 
 		 322 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  36.84 
 
 		 323 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  34.68 
 
 		 320 aa  90.9  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  38.41 
 
 		 301 aa  89.7  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  35.93 
 
 		 313 aa  89.4  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  30.81 
 
 		 334 aa  89  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  32.18 
 
 		 336 aa  88.6  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  35.36 
 
 		 325 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  36.14 
 
 		 313 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  39.76 
 
 		 321 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  42.14 
 
 		 312 aa  87.4  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  35.54 
 
 		 303 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  32.58 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  28.72 
 
 		 333 aa  82  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  29.14 
 
 		 315 aa  81.3  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  31.93 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  28.65 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  30.73 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  34.36 
 
 		 435 aa  75.1  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  30.46 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  28.34 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  24.86 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  36.42 
 
 		 320 aa  71.2  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  35.12 
 
 		 326 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  29.94 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  32.09 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  32.2 
 
 		 312 aa  66.6  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  30.06 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  29.22 
 
 		 325 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0594  Na+-dependent transporter-like protein  52.63 
 
 		 84 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  33.86 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  29.53 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  32.53 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  32.28 
 
 		 299 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  25.71 
 
 		 356 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  44 
 
 		 350 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  24.74 
 
 		 330 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2141  bile acid:sodium symporter  32.14 
 
 		 310 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.219683  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  27.27 
 
 		 307 aa  44.3  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  29.7 
 
 		 303 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>