83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0594 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0594  Na+-dependent transporter-like protein  100 
 
 		 84 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  60.32 
 
 		 320 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  63.33 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  63.33 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  57.14 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  60.66 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  60.32 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  59.38 
 
 		 319 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  63.79 
 
 		 321 aa  81.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  58.93 
 
 		 321 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  55.56 
 
 		 321 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  55.71 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  61.9 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  57.14 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  63.64 
 
 		 322 aa  78.2  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  60.71 
 
 		 315 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  60.71 
 
 		 315 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  59.26 
 
 		 321 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  60.71 
 
 		 315 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  61.11 
 
 		 334 aa  73.9  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  55.56 
 
 		 336 aa  74.3  0.0000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  61.54 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  61.54 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  61.54 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  52.5 
 
 		 319 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  48.44 
 
 		 323 aa  71.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  59.38 
 
 		 328 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  58.18 
 
 		 322 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  58.18 
 
 		 309 aa  70.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  58.18 
 
 		 322 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  55.74 
 
 		 351 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  58.18 
 
 		 325 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  61.22 
 
 		 305 aa  70.9  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  51.85 
 
 		 303 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  58.18 
 
 		 322 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  58.18 
 
 		 322 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  58.18 
 
 		 322 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  58.18 
 
 		 322 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  58.18 
 
 		 322 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  57.41 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  53.85 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  51.85 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  59.26 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  52.38 
 
 		 344 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  61.22 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  53.85 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  59.38 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  57.41 
 
 		 303 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  61.22 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  56.36 
 
 		 326 aa  68.6  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  61.22 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  51.92 
 
 		 308 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  57.14 
 
 		 309 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  57.14 
 
 		 309 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  55.1 
 
 		 308 aa  67  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  55.1 
 
 		 309 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  45.59 
 
 		 305 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  45.59 
 
 		 305 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  53.23 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  42.39 
 
 		 336 aa  65.5  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  53.57 
 
 		 316 aa  65.1  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  57.69 
 
 		 309 aa  64.7  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  54.24 
 
 		 325 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  69.09 
 
 		 350 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  52.63 
 
 		 207 aa  63.5  0.0000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  43.1 
 
 		 320 aa  62.4  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  51.72 
 
 		 310 aa  62  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  52.83 
 
 		 316 aa  62  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  55.1 
 
 		 356 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  45.16 
 
 		 325 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  49.09 
 
 		 329 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  61.54 
 
 		 335 aa  57.4  0.00000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  36.92 
 
 		 333 aa  53.5  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  47.27 
 
 		 315 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  40 
 
 		 312 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  37.29 
 
 		 435 aa  44.7  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  44 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  40.98 
 
 		 311 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  47.06 
 
 		 334 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  44.23 
 
 		 299 aa  42.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  38.71 
 
 		 438 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2141  bile acid:sodium symporter  43.14 
 
 		 310 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.219683  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  37.1 
 
 		 330 aa  40.4  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>