187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2284 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 
325 aa  634    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  67.73 
 
 
312 aa  389  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  53.25 
 
 
318 aa  309  4e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  51.97 
 
 
305 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  51.97 
 
 
305 aa  300  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  47.45 
 
 
321 aa  299  5e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  52.04 
 
 
322 aa  297  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  52.35 
 
 
322 aa  296  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  46.5 
 
 
321 aa  295  5e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  53.11 
 
 
318 aa  294  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  50.47 
 
 
322 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  50.47 
 
 
322 aa  292  6e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  50.47 
 
 
322 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  51.56 
 
 
325 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  50.16 
 
 
322 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  50.62 
 
 
299 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  49.84 
 
 
319 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  46.43 
 
 
321 aa  288  1e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  49.84 
 
 
322 aa  286  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  53.9 
 
 
311 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  45.05 
 
 
321 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  53.57 
 
 
311 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  50.47 
 
 
315 aa  281  9e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  49.23 
 
 
319 aa  280  3e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  52.31 
 
 
321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  51.89 
 
 
315 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  54 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  51.7 
 
 
324 aa  258  9e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  51.05 
 
 
351 aa  255  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  45.9 
 
 
344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  52.24 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  47.34 
 
 
319 aa  253  3e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  45.13 
 
 
310 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  48.68 
 
 
305 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  50.92 
 
 
334 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  46.46 
 
 
335 aa  247  2e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  42.81 
 
 
303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  45.81 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  42.81 
 
 
303 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  48.84 
 
 
309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  44.37 
 
 
314 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  42.09 
 
 
308 aa  243  5e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  42.63 
 
 
320 aa  242  6e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  42.28 
 
 
300 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  44.16 
 
 
308 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  41.81 
 
 
303 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  45.94 
 
 
319 aa  238  9e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  46.24 
 
 
319 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  43.04 
 
 
309 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  43.14 
 
 
300 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  45.48 
 
 
329 aa  237  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  42.72 
 
 
309 aa  235  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  41.8 
 
 
316 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  45.94 
 
 
316 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  48.66 
 
 
336 aa  233  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  46.3 
 
 
309 aa  232  6e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  49.53 
 
 
328 aa  230  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  47.28 
 
 
321 aa  229  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  47.94 
 
 
326 aa  229  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  45.62 
 
 
303 aa  226  4e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  43.04 
 
 
309 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  39.75 
 
 
333 aa  221  9.999999999999999e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  44.41 
 
 
313 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  46.57 
 
 
313 aa  220  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  39.72 
 
 
368 aa  218  8.999999999999998e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  44.44 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  41.74 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  45.73 
 
 
350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  43.36 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  40.39 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  43.05 
 
 
320 aa  211  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  37.83 
 
 
334 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  48.28 
 
 
320 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  38.21 
 
 
350 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  42.14 
 
 
315 aa  203  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  43.28 
 
 
340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  42.12 
 
 
356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  39.66 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  38.85 
 
 
292 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  38.51 
 
 
311 aa  176  7e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  40.19 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  42.12 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  37.32 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  41.47 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  32.87 
 
 
312 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  32.61 
 
 
289 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  35.21 
 
 
335 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  32.36 
 
 
316 aa  139  8.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  33.44 
 
 
307 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  43.26 
 
 
435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  34.26 
 
 
307 aa  130  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  34.03 
 
 
297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  39.74 
 
 
438 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  32.56 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  31.99 
 
 
303 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  33.45 
 
 
297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  33.68 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  33.57 
 
 
297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  33.81 
 
 
299 aa  125  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.19565 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>