164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  100 
 
 		 323 aa  621  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  50.65 
 
 		 318 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  64.74 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  46.77 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  46.77 
 
 		 321 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  52.65 
 
 		 335 aa  295  6e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  45.66 
 
 		 321 aa  291  8e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  52.16 
 
 		 334 aa  289  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  51.79 
 
 		 351 aa  289  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  54.79 
 
 		 322 aa  286  5e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  49.01 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  50.32 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  50.96 
 
 		 319 aa  278  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  50.32 
 
 		 318 aa  278  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  47.74 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  46.86 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  44.44 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  44.44 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  44.87 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  44.87 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  44.87 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  46.2 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  46.03 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  44.87 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  45.81 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  54.05 
 
 		 319 aa  263  4e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  44.23 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  44.07 
 
 		 300 aa  252  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  44.07 
 
 		 303 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  43.73 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  43.71 
 
 		 308 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  43.73 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  54.05 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  47.6 
 
 		 315 aa  248  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  45.67 
 
 		 344 aa  248  1e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  50.33 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  46.62 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  49.68 
 
 		 311 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  46.98 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  56.83 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  46.21 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  56.04 
 
 		 350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  45.2 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  43.6 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  43.25 
 
 		 309 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  43.52 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  42.86 
 
 		 300 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  42.9 
 
 		 309 aa  232  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  40 
 
 		 320 aa  232  7.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  43.93 
 
 		 303 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  43.48 
 
 		 309 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  44.22 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  46.58 
 
 		 336 aa  228  1e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  47.06 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  45.1 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  48 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  46.35 
 
 		 321 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  45.45 
 
 		 315 aa  225  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  45.86 
 
 		 315 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  44.13 
 
 		 301 aa  224  2e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  43.45 
 
 		 316 aa  217  2e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  41.58 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  45.42 
 
 		 329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  42.9 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  45.43 
 
 		 324 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  45.42 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  46.59 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  40.85 
 
 		 292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  44.32 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  43.99 
 
 		 340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  43.97 
 
 		 326 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  39.07 
 
 		 316 aa  194  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  37.75 
 
 		 325 aa  194  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  41.45 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  43.87 
 
 		 334 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  36.24 
 
 		 368 aa  186  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  35.48 
 
 		 334 aa  185  7e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  36.92 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  34.74 
 
 		 333 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  41.33 
 
 		 311 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  43.22 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  35.97 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  36.6 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  27.27 
 
 		 435 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  33.01 
 
 		 330 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  36.4 
 
 		 266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  31.69 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  32.08 
 
 		 316 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  33.09 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  31.44 
 
 		 297 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  31.44 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  27.96 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  31.44 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  29.07 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  33.9 
 
 		 299 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  33.06 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  36.84 
 
 		 207 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  33.06 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  30.71 
 
 		 294 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  31.85 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>