160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1506 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 319 aa  624  1e-178  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  87.46 
 
 		 319 aa  530  1e-149  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  63.09 
 
 		 318 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  61.71 
 
 		 318 aa  359  4e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  57.59 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  58.73 
 
 		 315 aa  349  4e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  58.84 
 
 		 311 aa  335  5e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  58.2 
 
 		 311 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  51.79 
 
 		 321 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  52.44 
 
 		 321 aa  328  7e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  51.47 
 
 		 321 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  58.47 
 
 		 321 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  51.83 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  51.83 
 
 		 305 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  53.97 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  51.78 
 
 		 321 aa  308  9e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  57.51 
 
 		 315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  57.83 
 
 		 315 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  53.33 
 
 		 322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  53.02 
 
 		 322 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  54.09 
 
 		 325 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  52.7 
 
 		 322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  52.7 
 
 		 322 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  52.7 
 
 		 322 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  52.7 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  49.23 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1299  bile acid:sodium symporter  55.84 
 
 		 324 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  50.66 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  50.98 
 
 		 329 aa  275  8e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  55.02 
 
 		 312 aa  275  8e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  50.32 
 
 		 323 aa  274  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  49.83 
 
 		 335 aa  272  6e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  42.9 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  46.28 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  50.53 
 
 		 334 aa  268  8e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  45.31 
 
 		 305 aa  265  8e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  51.62 
 
 		 322 aa  265  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  46.27 
 
 		 336 aa  262  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  51.38 
 
 		 321 aa  262  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  44.85 
 
 		 314 aa  257  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  50.67 
 
 		 336 aa  256  2e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  45.13 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  46.03 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  43.38 
 
 		 309 aa  249  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  44 
 
 		 319 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  44.48 
 
 		 303 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  51.12 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  44.48 
 
 		 308 aa  245  6.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  44.48 
 
 		 303 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  44.15 
 
 		 303 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  41.16 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  44.59 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  45.12 
 
 		 303 aa  238  8e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  41.88 
 
 		 325 aa  238  8e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  44.33 
 
 		 308 aa  238  9e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  43.33 
 
 		 309 aa  238  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2744  Bile acid:sodium symporter  51.11 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  43.81 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  44.92 
 
 		 326 aa  235  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  40.51 
 
 		 316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  42.23 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  44.48 
 
 		 301 aa  231  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  50.16 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  44.19 
 
 		 313 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  42.45 
 
 		 300 aa  227  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  44.19 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  43.06 
 
 		 356 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  43 
 
 		 309 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  44.07 
 
 		 303 aa  222  8e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  41.06 
 
 		 315 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  41.56 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0647  sodium-dependent transporter  39.56 
 
 		 333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00310924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0419  Bile acid:sodium symporter  50.84 
 
 		 350 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.136029  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  40.85 
 
 		 368 aa  212  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  42 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  37.3 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  40.26 
 
 		 320 aa  205  6e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  39.04 
 
 		 292 aa  203  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  41.12 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  37.12 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  41 
 
 		 310 aa  181  1e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  37.58 
 
 		 319 aa  172  6.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_3046  predicted protein  35.22 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3419  bile acid:sodium symporter  32.57 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2744  Bile acid:sodium symporter  32.84 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2140  Bile acid:sodium symporter  32.05 
 
 		 438 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  31.52 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  33.68 
 
 		 298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  29.73 
 
 		 303 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  30.91 
 
 		 293 aa  129  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0856  putative Na+-dependent transporter/bile acid symporter  44.83 
 
 		 207 aa  129  7.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  30.58 
 
 		 316 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12281  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  34.11 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  31.21 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  31.67 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2207  Bile acid:sodium symporter  32.76 
 
 		 299 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  31.45 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  30.82 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  29.32 
 
 		 297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  32.57 
 
 		 297 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>