127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0369 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 288 aa  565  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  36.33 
 
 		 289 aa  160  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  37.63 
 
 		 335 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  34.29 
 
 		 298 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  36.03 
 
 		 307 aa  148  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  33.96 
 
 		 303 aa  148  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  33.91 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  32.85 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  31.77 
 
 		 299 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  32.85 
 
 		 297 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  31.05 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  33.09 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  30.71 
 
 		 297 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  32.49 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  29.75 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  29.17 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  28 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  30.22 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  30.9 
 
 		 297 aa  115  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  30.15 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  30.15 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0306  Bile acid:sodium symporter  29.54 
 
 		 295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  31.23 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  32.73 
 
 		 297 aa  113  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  28.74 
 
 		 325 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  32.97 
 
 		 321 aa  112  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  30.48 
 
 		 294 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  28.4 
 
 		 350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  29.12 
 
 		 296 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  28.68 
 
 		 297 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  26.57 
 
 		 312 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  28.93 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  32.16 
 
 		 340 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  33.06 
 
 		 321 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  30.48 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  31.52 
 
 		 321 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  28.89 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  29.93 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  31.43 
 
 		 335 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  25.95 
 
 		 315 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  30.08 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  29.03 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  29.84 
 
 		 334 aa  99  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  30.25 
 
 		 319 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  28.78 
 
 		 316 aa  98.2  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  28.81 
 
 		 320 aa  97.4  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  31.2 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  29.96 
 
 		 319 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  25.51 
 
 		 314 aa  95.9  7e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  29.15 
 
 		 319 aa  95.9  7e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  30.33 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  29.92 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  29.92 
 
 		 303 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  26.76 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  27.56 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  29.92 
 
 		 300 aa  94  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  30.04 
 
 		 334 aa  93.2  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  32.1 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  25.62 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  28.57 
 
 		 308 aa  93.2  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  25.62 
 
 		 319 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  27.11 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  26.95 
 
 		 300 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  27.67 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  30.31 
 
 		 336 aa  90.1  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  29.09 
 
 		 285 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4446  bile acid:sodium symporter  25.93 
 
 		 313 aa  89.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4530  bile acid:sodium symporter  25.93 
 
 		 313 aa  89  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.212547 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  31.69 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1667  bile acid:sodium symporter  27.97 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0104917  hitchhiker  0.00786387 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  30.25 
 
 		 310 aa  88.2  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  31.45 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  28.01 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  27.64 
 
 		 303 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  24.38 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  27.05 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2835  sodium-dependent transporter  32.11 
 
 		 326 aa  86.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0364013  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  29.57 
 
 		 319 aa  86.7  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  26.29 
 
 		 321 aa  86.3  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_4131  BASS family transporter: sodium ion/bile acid  26.07 
 
 		 292 aa  85.9  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.275751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  25.71 
 
 		 315 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  30.31 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  27.27 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3898  sodium/bile acid symporter family protein  27.4 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0624185  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  27.78 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  30.86 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  27.89 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  24.28 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  27.5 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  26.33 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  26.86 
 
 		 320 aa  80.1  0.00000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1136  Bile acid:sodium symporter  31.82 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0287814  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1587  bile acid:sodium symporter  26.86 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  28.03 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  30.67 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  26.53 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  31.15 
 
 		 309 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0839  sodium/bile acid symporter family protein  36.04 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00253549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1312  Bile acid:sodium symporter  39.13 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02093  P3 protein  32.03 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000002356  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>