135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2679 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2679  bile acid:sodium symporter  100 
 
 		 297 aa  577  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.401934  normal  0.860091 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2664  bile acid:sodium symporter  77.4 
 
 		 299 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  79.72 
 
 		 297 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43170  bile acid/Na+ symporter family transporter  77.63 
 
 		 297 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.363459 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  77.47 
 
 		 297 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  77.47 
 
 		 297 aa  408  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  77.13 
 
 		 297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2779  bile acid:sodium symporter  59.93 
 
 		 296 aa  308  5e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.142136  hitchhiker  0.000611916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2868  Bile acid:sodium symporter  60.57 
 
 		 293 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0584771  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2582  bile acid:sodium symporter  58.42 
 
 		 296 aa  299  5e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.100414 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4290  bile acid:sodium symporter  56.69 
 
 		 292 aa  285  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0306  Bile acid:sodium symporter  53.1 
 
 		 295 aa  267  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.318407 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  47.18 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  49.26 
 
 		 291 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  44.2 
 
 		 298 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  43.16 
 
 		 289 aa  206  4e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  45.99 
 
 		 307 aa  205  9e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  46.01 
 
 		 294 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  39.51 
 
 		 297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  39.02 
 
 		 307 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  39.64 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  38.99 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  35.11 
 
 		 297 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  37.54 
 
 		 315 aa  146  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  34.51 
 
 		 284 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  33.83 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  33.83 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  30.8 
 
 		 316 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1365  solute/sodium symporter  33.79 
 
 		 344 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  34.44 
 
 		 322 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  32.44 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5701  Bile acid:sodium symporter  34.97 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3652  bile acid:sodium symporter  33.21 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4117  bile acid:sodium symporter  32.22 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  31.11 
 
 		 288 aa  125  7e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02093  P3 protein  37.44 
 
 		 221 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000002356  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0222  Bile acid:sodium symporter  31.99 
 
 		 303 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0522725 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3800  bile acid:sodium symporter  32.85 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0220  bile acid:sodium symporter  32.22 
 
 		 303 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  32.26 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  30.22 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4238  bile acid:sodium symporter  32.22 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00038302 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  32.18 
 
 		 321 aa  123  4e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2456  Bile acid:sodium symporter  29.43 
 
 		 368 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0625  sodium/bile acid cotransporter family protein  31.93 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.667593  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0999  bile acid:sodium symporter  31.79 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0120798  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4519  sodium-dependent transporter  32.47 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  30.86 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  29.93 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1540  bile acid:sodium symporter  30.4 
 
 		 321 aa  120  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3925  bile acid:sodium symporter  33.08 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3507  bile acid:sodium symporter  31.23 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0093  Bile acid:sodium symporter  29.93 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0445  Bile acid:sodium symporter  33.09 
 
 		 334 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1257  bile acid:sodium symporter  28.83 
 
 		 293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.798297 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0102  bile acid:sodium symporter  32.75 
 
 		 351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6460  Bile acid:sodium symporter  29.48 
 
 		 350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0116  Bile acid:sodium symporter  30.36 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03710  predicted Na+-dependent transporter  32.38 
 
 		 335 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1633  bile acid:sodium symporter  31.84 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  32.61 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  30.04 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1506  Bile acid:sodium symporter  30.56 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.221367  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2945  Bile acid:sodium symporter  28.78 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0066  Bile acid:sodium symporter  31.87 
 
 		 309 aa  112  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0354306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1040  BASS family Na(+)/bile acid symporter  28.41 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2042  Na+-transporting methylmalonyl-CoA/oxaloacetate decarboxylase, beta subunit  28.32 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1688  sodium/bile acid transporter family protein  30.4 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.37024  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3729  bile acid:sodium symporter  32.49 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.51289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0574  bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 		 321 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0921  Bile acid:sodium symporter  31.96 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.215588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  32.01 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1409  Bile acid:sodium symporter  34.72 
 
 		 336 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_4286  predicted protein  34.26 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.717373  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20150  predicted Na+-dependent transporter  29.64 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.226359  normal  0.0276347 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21970  bile acid transporter  31.77 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  28.62 
 
 		 314 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4097  bile acid:sodium symporter  28.73 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.64867  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  31.5 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4480  bile acid:sodium symporter  28.15 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1219  bile acid:sodium symporter  27.72 
 
 		 303 aa  105  6e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2660  Bile acid:sodium symporter  31.27 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3274  Bile acid:sodium symporter  33.33 
 
 		 329 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0353  Na+-dependent transporter-like  32.63 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3303  bile acid:sodium symporter  31.82 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0688105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3145  bile acid:sodium symporter  30.11 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142756  normal  0.0139778 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3529  bile acid transporter family protein  28.28 
 
 		 322 aa  102  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.347083  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21780  putative transporter  29.39 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.919713  normal  0.169757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1857  putative transporter  30.04 
 
 		 311 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0160681  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1996  Bile acid:sodium symporter  31.25 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3277  bile acid transporter family protein  28.69 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3314  bile acid transporter family protein  28.28 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0675599  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3574  bile acid transporter family protein  28.28 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0718413  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3535  bile acid transporter family protein  27.87 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3529  bile acid transporter family protein  28.28 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000674215 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2354  Bile acid:sodium symporter  29.12 
 
 		 300 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  29.15 
 
 		 325 aa  99  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3229  bile acid transporter family protein  27.87 
 
 		 322 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  28.41 
 
 		 301 aa  98.2  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>