More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_11401 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1060  ABC transporter substrate-binding protein  76.29 
 
 		 523 aa  821    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.543795  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11541  ABC transporter substrate-binding protein  76.48 
 
 		 523 aa  825    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11401  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 		 523 aa  1045    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11551  ABC transporter substrate-binding protein  76.86 
 
 		 523 aa  826    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15381  ABC transporter substrate-binding protein  52.52 
 
 		 525 aa  548  1e-155  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.318492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11431  ABC transporter substrate-binding protein  51.37 
 
 		 534 aa  542  1e-153  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.88428 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1959  ABC transporter substrate-binding protein  47.23 
 
 		 535 aa  533  1e-150  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0704  ABC transporter substrate-binding protein  53.67 
 
 		 525 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08861  ABC transporter substrate-binding protein  49.69 
 
 		 491 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0702  ABC transporter substrate-binding protein  46.18 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0821  periplasmic oligopeptide-binding  34.34 
 
 		 533 aa  299  8e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3355  extracellular solute-binding protein  34.11 
 
 		 551 aa  274  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.188345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3994  extracellular solute-binding protein family 5  31.81 
 
 		 541 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1509  extracellular solute-binding protein  32.51 
 
 		 539 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000203418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  33.54 
 
 		 551 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  33.54 
 
 		 551 aa  252  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4118  family 1 extracellular solute-binding protein  30.5 
 
 		 543 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.794373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1666  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 501 aa  158  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1600  extracellular solute-binding protein  26.42 
 
 		 501 aa  150  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1188  extracellular solute-binding protein  25.64 
 
 		 499 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000019193  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  26.49 
 
 		 524 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1781  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 501 aa  133  6e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000533035  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  26.77 
 
 		 534 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.58 
 
 		 535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1494  extracellular solute-binding protein  26.06 
 
 		 526 aa  128  3e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.69615 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  22.49 
 
 		 528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 528 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0602  extracellular solute-binding protein  24.17 
 
 		 545 aa  125  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.497567  hitchhiker  0.000000266408 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0422  extracellular solute-binding protein  25.21 
 
 		 525 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0111  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3006  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 544 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.38 
 
 		 510 aa  117  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.04 
 
 		 505 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2424  twin-arginine translocation pathway signal  23.11 
 
 		 565 aa  115  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0912792  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7516  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  30.14 
 
 		 565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  24.12 
 
 		 512 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0453  4-phytase  23.6 
 
 		 526 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1690  extracellular solute-binding protein  24.25 
 
 		 532 aa  109  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23662  normal  0.232631 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1552  extracellular solute-binding protein  24.2 
 
 		 551 aa  109  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4369  extracellular solute-binding protein family 5  22.48 
 
 		 536 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2498  extracellular solute-binding protein  22.2 
 
 		 547 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.10844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0490  extracellular solute-binding protein family 5  23.85 
 
 		 531 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2148  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 538 aa  104  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  24.61 
 
 		 526 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  24.03 
 
 		 535 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1471  periplasmic murein peptide-binding protein  23.4 
 
 		 537 aa  103  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.857837  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2658  extracellular solute-binding protein family 5  25.93 
 
 		 529 aa  103  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293814 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0211  dipeptide ABC transporter periplasmic protein  26.77 
 
 		 544 aa  103  8e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1804  periplasmic murein peptide-binding protein  23.79 
 
 		 537 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.048276  normal  0.542022 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2915  extracellular solute-binding protein  23.74 
 
 		 547 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  22.29 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0139  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 520 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.382397 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1653  periplasmic murein peptide-binding protein  23.21 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0552012 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1865  periplasmic murein peptide-binding protein  23.21 
 
 		 537 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  normal  0.987558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0484  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 523 aa  103  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.036637  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  23.65 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2938  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 531 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  23.21 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1605  extracellular solute-binding protein  24.6 
 
 		 595 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  24.04 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  25.96 
 
 		 607 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0381  extracellular solute-binding protein  24.95 
 
 		 531 aa  101  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.265556 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 519 aa  101  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  27.7 
 
 		 518 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6266  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.16 
 
 		 531 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.857663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1803  periplasmic murein peptide-binding protein  22.97 
 
 		 537 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501366 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2816  extracellular solute-binding protein  22.71 
 
 		 545 aa  100  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.54552  normal  0.0589435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2342  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 		 580 aa  100  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2309  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 534 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2914  extracellular solute-binding protein  23.32 
 
 		 543 aa  100  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2552  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 		 541 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0329561 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2923  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 534 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2972  extracellular solute-binding protein  24.26 
 
 		 531 aa  100  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1189  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 525 aa  100  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0440454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  26.05 
 
 		 527 aa  100  9e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5116  ABC transporter periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 531 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3775  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  24.05 
 
 		 556 aa  99  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58420  putative binding protein component of ABC dipeptid  23.8 
 
 		 533 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.851894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1671  extracellular solute-binding protein  22.33 
 
 		 538 aa  99  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.901467 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3692  extracellular solute-binding protein family 5  22.57 
 
 		 526 aa  99.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  25.29 
 
 		 521 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2835  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 531 aa  98.2  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.827526 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1638  extracellular solute-binding protein  22.95 
 
 		 529 aa  98.6  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.343389  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  26.52 
 
 		 521 aa  97.8  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1319  extracellular solute-binding protein family 5  24.24 
 
 		 521 aa  98.2  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0396363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58390  putative binding protein component of ABC transpor  22.29 
 
 		 533 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1572  putative ABC transporter periplasmic-binding protein yddS precursor  23.96 
 
 		 516 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2170  extracellular solute-binding protein  23.96 
 
 		 516 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.233404  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01445  D-ala-D-a la transporter subunit  23.96 
 
 		 516 aa  96.3  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  26.35 
 
 		 513 aa  96.7  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1805  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  22.96 
 
 		 525 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  22.87 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2580  extracellular solute-binding protein  24.71 
 
 		 541 aa  96.3  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1977  extracellular solute-binding protein  22.37 
 
 		 506 aa  95.9  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.719795 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  22.2 
 
 		 532 aa  96.3  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3755  extracellular solute-binding protein family 5  22.93 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05920  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.8 
 
 		 507 aa  95.9  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 535 aa  95.5  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1792  periplasmic murein peptide-binding protein  23.64 
 
 		 537 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1615  extracellular solute-binding protein  22.82 
 
 		 541 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.577375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>