285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_04631 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_04631  lipoate-protein ligase B  100 
 
 
214 aa  436  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451371  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04521  lipoate-protein ligase B  76.85 
 
 
216 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04211  lipoate-protein ligase B  75.93 
 
 
216 aa  321  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00670281  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0397  lipoate-protein ligase B  76.85 
 
 
216 aa  301  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.135872  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03991  lipoate-protein ligase B  45.37 
 
 
235 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.28494  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2012  lipoate-protein ligase B  36.76 
 
 
232 aa  192  3e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1736  lipoate-protein ligase B  42.65 
 
 
239 aa  188  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04531  lipoate-protein ligase B  42.65 
 
 
244 aa  186  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.406399  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0659  lipoate-protein ligase B  36.97 
 
 
229 aa  185  5e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21401  lipoate-protein ligase B  43.79 
 
 
253 aa  181  6e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3220  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 
239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0755352  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2876  lipoyltransferase  37.91 
 
 
239 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2353  lipoyltransferase  36.04 
 
 
233 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4188  lipoyltransferase  40.11 
 
 
213 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0627971 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3031  lipoate-protein ligase B  37.37 
 
 
227 aa  151  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3184  lipoyltransferase  37.31 
 
 
221 aa  151  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.052426  normal  0.0826899 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1269  lipoate-protein ligase B  41.85 
 
 
214 aa  148  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4467  lipoate-protein ligase B  38.15 
 
 
230 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3883  lipoyltransferase  36.6 
 
 
202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.833664 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0350  lipoate-protein ligase B  41.18 
 
 
211 aa  144  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2075  lipoate-protein ligase B  37.13 
 
 
237 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2747  lipoate-protein ligase B  41.42 
 
 
213 aa  137  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1701  lipoate-protein ligase B  42.77 
 
 
231 aa  137  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2259  lipoate-protein ligase B  37.07 
 
 
259 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0707  lipoate-protein ligase B  42.11 
 
 
204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2434  lipoate-protein ligase B  38.82 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.824182  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6764  lipoate-protein ligase B  35.87 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41526  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0229  lipoate-protein ligase B  42.61 
 
 
231 aa  132  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.970877  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04288  lipoate-protein ligase B  33.97 
 
 
224 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1026  lipoate-protein ligase B  32.14 
 
 
262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00000441542  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1922  lipoate-protein ligase B  38.55 
 
 
232 aa  131  6.999999999999999e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0097  lipoate-protein ligase B  36 
 
 
207 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0454  lipoate-protein ligase B  38.51 
 
 
224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0665  lipoate-protein ligase B  37.91 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1031  lipoate-protein ligase B  38.6 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.242736  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_51454  lipoate-protein ligase  39.61 
 
 
157 aa  130  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.444704  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1045  lipoyltransferase  32.37 
 
 
246 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0860459  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_51519  lipoate-protein ligase  41.67 
 
 
167 aa  129  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.313416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0719  lipoate-protein ligase B  38.04 
 
 
204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.24811e-18 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05530  lipoate-protein ligase B  37.57 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2081  lipoate-protein ligase B  33.66 
 
 
237 aa  128  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.252656  normal  0.240357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2774  lipoate-protein ligase B  34.95 
 
 
225 aa  128  7.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.258038  normal  0.144607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6295  lipoate-protein ligase B  33.68 
 
 
236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1252  lipoyltransferase  33.85 
 
 
216 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.33407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1912  lipoate-protein ligase B  37.63 
 
 
238 aa  125  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1401  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 
223 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.482656  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5311  lipoate-protein ligase B  35.43 
 
 
235 aa  124  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0319626 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1514  lipoyltransferase  34.62 
 
 
199 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0466  lipoyltransferase  43.24 
 
 
244 aa  122  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4211  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 
244 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.374535 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3805  lipoate-protein ligase B  31.37 
 
 
243 aa  122  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0737011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1996  lipoate-protein ligase B  36.88 
 
 
216 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.895983  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0698  lipoate-protein ligase B  33.7 
 
 
244 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3655  lipoate-protein ligase B  31.58 
 
 
270 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.347972  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4581  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 
244 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0695462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2037  lipoate-protein ligase B  36.17 
 
 
228 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1948  lipoate-protein ligase B  33.18 
 
 
243 aa  122  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4082  lipoate-protein ligase B  32.18 
 
 
262 aa  121  7e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4726  lipoate-protein ligase B  32.77 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.78228  normal  0.0194812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2039  lipoate-protein ligase B  35.63 
 
 
365 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.237895  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2109  lipoate-protein ligase B  35.63 
 
 
365 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0939106  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3712  lipoate-protein ligase B  34.25 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0555  lipoate-protein ligase B  35.16 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2381  lipoate-protein ligase B  31.86 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.735279  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3443  lipoate-protein ligase B  32.29 
 
 
236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.822951  normal  0.715309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3096  lipoate-protein ligase B  32.83 
 
 
246 aa  119  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0475303  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2842  lipoate-protein ligase B  31.5 
 
 
214 aa  119  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117951  hitchhiker  0.000142913 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0589  lipoate-protein ligase B  31.58 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1469  lipoyltransferase  34.07 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1745  lipoate-protein ligase B  35.43 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548162  normal  0.138545 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0555  lipoate-protein ligase B  29.33 
 
 
226 aa  118  6e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.668487  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1621  lipoate-protein ligase B  30.84 
 
 
239 aa  118  6e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00888371  normal  0.103618 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08450  lipoate-protein ligase B  34.76 
 
 
218 aa  118  7e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1821  lipoate-protein ligase B  35.06 
 
 
365 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10460  lipoate-protein ligase B  35.05 
 
 
246 aa  117  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00811076  normal  0.015008 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2163  lipoyltransferase  34.05 
 
 
241 aa  118  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3161  lipoate-protein ligase B  34.46 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4964  lipoate-protein ligase B  33.93 
 
 
215 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1999  lipoate-protein ligase B  33.52 
 
 
383 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5876  lipoate-protein ligase B  37.35 
 
 
245 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.615379 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1936  lipoyltransferase  32.04 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00922586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0094  lipoate-protein ligase B  38.06 
 
 
222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2954  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 
233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000757866  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0832  lipoate-protein ligase B  30.95 
 
 
235 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3026  lipoate-protein ligase B  33.91 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0519842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1871  lipoate-protein ligase B  32.42 
 
 
237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.159982  normal  0.0798648 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0898  lipoate-protein ligase B  33.33 
 
 
241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.572856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1854  lipoate-protein ligase B  33.91 
 
 
232 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3348  lipoate-protein ligase B  32.96 
 
 
247 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292157  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7617  predicted protein  34.3 
 
 
186 aa  116  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1014  lipoate-protein ligase B  35.2 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.449501  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2074  lipoate-protein ligase B  32.42 
 
 
237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1112  lipoate-protein ligase B  35.4 
 
 
217 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0609  lipoate-protein ligase B  39.02 
 
 
228 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1350  lipoate-protein ligase B  34.43 
 
 
217 aa  115  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.619841  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12120  lipoate-protein ligase B  35.4 
 
 
217 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0620  lipoate-protein ligase B  34.57 
 
 
215 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0600  lipoate-protein ligase B  28.85 
 
 
226 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1196  lipoate-protein ligase B  32.51 
 
 
222 aa  115  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1344  lipoate-protein ligase B  34.03 
 
 
247 aa  114  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.156336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>