More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1494 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  100 
 
 		 451 aa  855    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  37.67 
 
 		 450 aa  279  7e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  38.51 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  35.2 
 
 		 451 aa  257  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  33.79 
 
 		 457 aa  251  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  37.56 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  32.75 
 
 		 461 aa  236  5.0000000000000005e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 454 aa  229  8e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0953  MATE efflux family protein  39.63 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3583  MATE efflux family protein  38.76 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.662735  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5262  multidrug efflux protein NorA  38.04 
 
 		 462 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00407645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  34.71 
 
 		 466 aa  209  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5314  multidrug efflux protein NorA  38.93 
 
 		 462 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.133881 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  34.25 
 
 		 457 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  37.76 
 
 		 470 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5172  multidrug efflux protein NorA  38.27 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  38.15 
 
 		 470 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5517  multidrug efflux protein NorA  36.49 
 
 		 464 aa  200  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  34.65 
 
 		 460 aa  199  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0208  multidrug efflux protein NorA  38.55 
 
 		 462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0521775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  36.05 
 
 		 474 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  34.53 
 
 		 457 aa  196  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  34.53 
 
 		 457 aa  196  7e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  34.53 
 
 		 457 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  33.19 
 
 		 458 aa  193  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1146  MATE efflux family protein  37.53 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.890459  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0073  multidrug efflux protein NorA  34.44 
 
 		 460 aa  188  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  31.89 
 
 		 458 aa  188  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6069  multidrug efflux protein NorA  35.36 
 
 		 462 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  34.13 
 
 		 472 aa  186  8e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  32.74 
 
 		 457 aa  183  5.0000000000000004e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  31.56 
 
 		 457 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  37.53 
 
 		 460 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  30.77 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  31.79 
 
 		 471 aa  180  4e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  30.47 
 
 		 457 aa  179  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  31.79 
 
 		 471 aa  179  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0697  multi anti extrusion protein MatE  37.3 
 
 		 468 aa  178  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.596572  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  31.79 
 
 		 470 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  33.1 
 
 		 459 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  31.22 
 
 		 457 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  31.19 
 
 		 477 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  35.15 
 
 		 486 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  33.11 
 
 		 472 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  31.19 
 
 		 477 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  33.04 
 
 		 460 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0255  multidrug efflux protein NorA  34.38 
 
 		 461 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  35.96 
 
 		 467 aa  177  5e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  33.56 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  33.56 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  33.56 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  33.56 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  33.56 
 
 		 457 aa  176  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  33.56 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  33.56 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  33.56 
 
 		 457 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  31.49 
 
 		 455 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  30.94 
 
 		 456 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  35.07 
 
 		 462 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  30.4 
 
 		 460 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  34.84 
 
 		 462 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1166  MATE efflux family protein  31.42 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0236579  normal  0.0144354 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0454  MATE efflux family protein  34.45 
 
 		 477 aa  173  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  33.85 
 
 		 457 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  33.85 
 
 		 457 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  33.63 
 
 		 457 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  33.85 
 
 		 457 aa  172  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0115  multidrug resistance protein NorM, putative  33.41 
 
 		 460 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  33.63 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  33.18 
 
 		 470 aa  172  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  30.34 
 
 		 457 aa  171  3e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  33.98 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1761  MATE efflux family protein  31.36 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129666  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02164  multidrug efflux protein NorA  30.72 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2295  MATE efflux family protein  32.17 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  33.03 
 
 		 451 aa  168  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  32.12 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1356  MATE efflux family protein  30.87 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  32.39 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69890  multidrug efflux protein NorA  34.38 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  33.55 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  32.95 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2031  MATE efflux family protein  31.74 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  34.36 
 
 		 462 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2039  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.017072  normal  0.0193468 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  33.55 
 
 		 468 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  33.55 
 
 		 468 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  33.55 
 
 		 468 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  33.55 
 
 		 468 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2025  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.321717 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  33.55 
 
 		 468 aa  167  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3309  MATE efflux family protein  34.23 
 
 		 479 aa  166  5e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2967  MATE efflux family protein  31.38 
 
 		 467 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0284207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1951  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 459 aa  166  9e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000663691  normal  0.290024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  28.74 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  31.32 
 
 		 461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  32.81 
 
 		 451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>