48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1268 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1268  glucosylceramidase  100 
 
 		 475 aa  985    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04190  glycoside hydrolase family 30  47.76 
 
 		 445 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1287  glucosylceramidase  50 
 
 		 476 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0097  Glucosylceramidase  44.75 
 
 		 446 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6735  glycoside hydrolase family 30  45.51 
 
 		 485 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.39769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1563  glycoside hydrolase family protein  43.5 
 
 		 487 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.361336  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1562  glycoside hydrolase family protein  43.45 
 
 		 487 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0858  glycoside hydrolase family protein  38.39 
 
 		 445 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3404  glycoside hydrolase family protein  36.12 
 
 		 441 aa  302  1e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.316905  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4708  O-Glycosyl hydrolase family 30  34.35 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.319201  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3714  glycosy hydrolase family protein  32.05 
 
 		 567 aa  266  7e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.171767  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0296  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.68 
 
 		 484 aa  247  4e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3716  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.37 
 
 		 648 aa  244  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082152 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6736  glycoside hydrolase family 30  34.53 
 
 		 485 aa  237  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.338177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5601  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.93 
 
 		 505 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.621128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.07 
 
 		 627 aa  226  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1106  glycoside hydrolase family protein  35.93 
 
 		 488 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0729101  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4153  glucosylceramidase  34.29 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.450582  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3590  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  33.92 
 
 		 486 aa  223  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00155681  hitchhiker  0.000521994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2067  glycoside hydrolase family protein  34.72 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0826948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2261  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  34.62 
 
 		 514 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.103038  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1566  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.58 
 
 		 474 aa  200  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2994  glucosylceramidase  35.8 
 
 		 481 aa  200  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.389806  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  35.23 
 
 		 666 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1905  glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.32 
 
 		 695 aa  199  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54536  predicted protein  29.09 
 
 		 859 aa  195  1e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4906  Ricin B lectin  36.63 
 
 		 603 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.20179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0445  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  28.94 
 
 		 501 aa  191  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4287  Ricin B lectin  31.97 
 
 		 647 aa  180  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.718232  normal  0.560117 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34530  O-glycosyl hydrolase  30.16 
 
 		 447 aa  180  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0928159  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1516  glycoside hydrolase family 30  35.31 
 
 		 481 aa  179  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5017  glycoside hydrolase family 30  29.23 
 
 		 484 aa  177  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000784671  normal  0.283576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2992  helix-turn-helix, AraC type  29.11 
 
 		 982 aa  176  8e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0557584  hitchhiker  0.000000421127 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3362  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.39 
 
 		 497 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4356  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  29.55 
 
 		 603 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641869  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1833  O-glycosyl hydrolase  29.29 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7221  Ricin B lectin  26.71 
 
 		 634 aa  156  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.243667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2134  Glucuronoarabinoxylan endo-1,4-beta-xylanase  23.39 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.300272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04558  xylanase  24.1 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.992142  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0649  cellulosome protein dockerin type I  23.85 
 
 		 532 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  21.77 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2746  Ricin B lectin  21.52 
 
 		 726 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.865768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  21.76 
 
 		 982 aa  60.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3012  carbohydrate-binding family 6 protein  24.01 
 
 		 630 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  25.79 
 
 		 629 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  24.25 
 
 		 681 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1486  glycoside hydrolase family 30  22.65 
 
 		 544 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  25.36 
 
 		 1217 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>